因为长时间久坐或者右上肢剧烈运动导致的右侧肩胛骨区肌肉拉伤或者软组织损伤，进而出现局部的炎症反应，导致疼痛，也有可能因为颈椎病或者颈椎间盘突出症，突出的椎间盘或者增生的骨刺压迫神经，导致神经支配区域放射性疼痛。
肩胛骨疼痛的原因较多，可继发于心绞痛、心肌梗死、心脏病、颈椎病等疾病，亦可继发于感受寒凉。因此，若出现肩胛骨疼痛症状，需及时查体、X光片、核磁共振等检查以明确诊断，进而给予针对性治疗。
右肩胛骨下方疼痛多见于有一些疾病比如胆囊炎，胆囊和右肩等部位感觉神经有重叠部分，所以胆囊炎会引起右肩与右肩胛下疼痛。如果除了肩痛以外还有反复发作的胃部灼热、嗳气、反酸、腹胀、恶心等消化不良症状。
左右肩胛骨疼痛应该与长期久坐和低头工作有关，属于肌肉韧带慢性劳损的表现。可以到正规医院进行胸部x光检查和腹部超声检查，排除体内脏器病变的可能。要改正不良的坐姿，多做腰背部的伸展运动，适当参加体育锻炼，戒除烟酒。
原因如下：姿势不当：现在看电脑的人多了，伏案、写东西的人多了，由于桌子高低，伏案工作姿势不当，会出现颈肩部肌肉僵硬，肩胛骨酸痛；受凉、受寒：由于寒气，因为肩关节作为关节共同点，活动幅度比较大，周围保护肌肉比较少，特别容易受凉。
是因为长时间低头、伏案工作或者重体力劳动导致的颈肩背部肌肉劳损、筋膜发炎，进而出现疼痛。主要表现为肩胛骨内侧缘区的酸胀痛，用手按压时可诱发疼痛，用手叩击时反而会觉得比较舒服。