可自我愈合，不需手术。腘窝囊肿可分为先天和后天两种，前者多见于儿童，后者可由滑囊本身的疾病如慢性无菌性炎症等引起，部分是并发于慢性膝关节病变而导致的。老年人发病则多与膝关节病变如骨性关节炎、半月板损伤等有关。
腘窝是膝关节后侧的一个解剖结构，发生在该处的囊肿就叫做腘窝囊肿。腘窝囊肿多见于膝关节本身有基础疾病，比如膝关节退行性关节炎、膝关节半月板的损伤、膝关节类风湿性关节炎等。
儿童腘窝囊肿是因为炎症引起的膝关节积液，膝关节活动使滑液向后移动形成腘窝囊肿，常见表现有发胀疼痛，症状严重可以影响活动，如果囊肿较大则建议手术治疗，注意休息避免膝关节过度活动。
腘窝囊肿不断增大，从而可以影响到膝关节的伸屈活动，尤其是可以明显的影响到膝关节的屈曲活动。另外，也可以造成对周围重要的血管神经的压迫，从而引起下肢的缺血症状。
腘窝囊肿通常都需要在手术切开治疗。在手术直视下将腘窝囊肿完全分离，完整的将整个囊壁切除下来。术中可以根据腘窝囊肿大小，决定是否先切开囊肿，将囊液放出，再做出进一步的囊壁剥离。
平时注意减少腘窝的活动，尽量减少膝关节处的刺激，爬楼梯或者长时间蹲的姿势尽量避免对于小的囊肿，无症状时不需要做任何治疗，但要定期复查，观察囊肿是否继续增大。严重的囊肿可考虑手术。