在临床上是非常常见的，如果没有什么不舒服的症状，是不需要特殊的治疗的，主要就是积极的注意休息，避免长时间的剧烈运动，如果有一些膝关节的滑膜炎骨性关节炎需要积极的进行治疗，否则关节积液增多容易导致囊肿的增大。如果局部囊肿增大明显，产生的局部明显肿胀的感觉，影响到关节活动受限，是需要积极进行手术治疗的，需要进行手术切除。
诊断出股骨骨囊中后尽早在医生建议下进行手术治疗。
股骨头囊肿是由于局部损伤，或股骨头血管栓塞，引起股骨头血运减少，并出现股骨头囊性变，后期形成囊肿。如不进行及时治疗，严重会导致骨皮质破坏，骨破坏局部增强，最终会造成病理性骨折；囊肿如果与软骨下骨距离较近的话，会引起股骨头塌陷，因此需通过手术将囊肿部位切除并在其部位充分植骨，以生成正常骨组织。
术后患者需避免运动，保持创口的干燥和卫生，保持正常作息，便于恢复。
坐骨囊肿又称坐骨结节囊肿，主要是因为坐骨部位的化液囊损伤引起的囊液增加。通常情况下，囊肿不会对坐骨神经造成疼痛，可以避免久坐、坐硬凳子等，可以定期做检查；对于已引起的坐骨神经痛，最好采用外科切除的方式进行治疗；如果有其它的炎症表现，可以进行引流，导入囊液，还可在医生指导下同时口服抗菌消炎的药物，促进病情恢复。
通常情况下，牙槽骨囊肿的患者可以通过日常护理、物理治疗、使用药物等方式进行治疗。具体情况分析如下：
炎牙槽骨囊肿性感染所导致的组织增生，如果患者的牙槽骨囊肿不明显，平时应注意口腔卫生。患者也可以按照医嘱使用活血化瘀的药物缓解症状，比如桃仁承气汤、血府逐瘀汤、复元活血汤、温经汤等。患者还可以通过刮除术进行治疗，以控制病情。
上颚骨囊肿可用牙线进行治疗，严重时需手术切除病理组织。
颚骨囊肿指颚骨内出现含有液体的囊性肿物，并逐步增大，从而导致颚骨膨胀破坏。病因有牙源性和非牙源性两类。上颌骨囊肿可进行牙线治疗，如洁治、刮治等。非牙源性囊肿是由胚胎的发育过程中残留在颚骨内颚骨上皮发展形成，不影响正常生活时可以先观察，定期复查即可。若情况严重，需进行手术治疗。术后复发的可能较高，手术时可将周围正常组织叶切除部分，能有效降低复发的可能性。上颚骨囊肿会引起长期的间歇性疼痛，患者应根据个人情况进行针对性治疗。除此之外，还应注意休息。慢性病患者需增强体质，避免过度劳累，吃富含营养的食物。建议患病期间少吃辛辣刺激性食物，适当增加体育锻炼，注意保暖，避免受凉感冒。