一侧卵巢囊肿能怀孕。因为囊肿长在一侧卵巢上，而另一侧的卵巢功能正常，怀孕的机理是精子经过宫颈到达子宫直至输卵管与到达这里的卵子结合再回到子宫着床的过程。只要这一过程不会干扰便不会影响正常受孕。所以卵巢只要有一侧有正常功能，没有输卵管方面的疾患，也不存在子宫方面的问题是不会影响受孕的。
一般情况下，卵巢囊肿的患者怀孕了，必须要检测囊肿有多大。如果卵巢囊肿在两三公分，并且生长比较缓慢，可以先不必担心，可以继续妊娠。如果卵巢囊肿超过五公分，可以考虑在医生的指导下进行手术切除。现在用微创手术，病人损失也比较小，囊肿摘除以后不影响胎儿生长发育。怀孕以后雌激素水平的刺激下，有的卵巢囊肿可能增长速度比较快，要密切观察囊肿的变化，患者要防止囊肿影响分娩，以免导致卵巢囊肿蒂扭转出现急腹症。
腹腔镜卵巢囊肿剔除术后一般一个月以后可以进行正常的性生活，如果有生育计划需要提前做好生育准备，应该到医院进行复查，一般3-6个月以后就可以了。如病理证实为良性肿瘤，那么囊肿切除后不需要避孕，怀孕的话正常孕检没事可以生下来，无需多虑。
卵巢囊肿在早孕时可能引起流产，中期妊娠时则易发生卵巢囊肿蒂扭转，晚期妊娠囊肿较大者可导致胎位异常，分娩时可能阻塞产道引起难产。妊娠期盆腔充血，可使肿瘤迅速增大甚至有引起恶变的可能。如果已经怀孕了，那么卵巢囊肿手术在16~24周时进行最为合适。
怀孕初期受激素影响有时候会出现卵巢囊肿，但是有的到三个月以后就会消失，即使存在一般也不影响胎儿，所以做好定期产检就可以了，加强营养，注意休息，有不适及时就诊。不要吃有剌激性食品。
怀孕了有卵巢囊，直径大于8厘米的囊肿，要做手术治疗，术后要注意休息和保胎治疗。直径大小在5厘米以内，又无任何症状的卵巢囊肿，不必作特殊处理，大部分可被机体吸收，自然消失，少吃辛辣油腻生冷刺激的食物。
