在手术室中，经常使用醋酸氯己定对手术后的环境进行消毒，因为它不仅可以杀灭常见的细菌，还可以对病毒起到抑制、杀灭的作用。在洗手以后，使用醋酸氯己定可以对手上的细菌病毒起到一定的抑制作用，所以醋酸氯己定在手术室的应用非常广泛。除了进行杀菌、消灭病毒以外，它还可用于清洁手术室使用的拖把，可以杀灭上面的细菌和病毒。
醋酸氯己定不是激素，又叫做醋酸氯己定，是一种抗菌药物，是一种阳离子表面活性剂，对于多种革兰氏阳性菌以及阴性菌都有杀灭作用。将醋酸氯己定配制成不同的浓度以及剂型用于消毒杀菌，比如用于卫生手消毒，外科手消毒，口腔漱口液等。在使用时尽量避免和阴离子表面活性物质的清洁剂同时使用。
醋酸氯己定是本身是一种消毒液，也可以做药品的抑菌剂，不用的浓度可以有不同的作用，高浓度用作杀菌剂，低浓度用作抑菌剂。它是一种阳离子表面活性剂，抗菌谱广，对多数革兰阳性及阴性细菌都有杀灭作用，对绿脓杆菌也有效。
这个药的作用，可以用这个药清洗外阴以起到消炎的作用。每天晚上拿这个药清洗外阴，避免把局部的皮肤弄破就可以。连续上7～10天为一个疗程，治疗期间禁止同房，少吃辛辣刺激性的食物。
主要适用于内痔、外痔等肛肠手术前后局部的杀菌消毒以及术后预防感染的发生，本身对治疗痔疮没有任何的效果。对黏膜有一定的刺激作用，可能会有肛门部不适，需要直肠给药，避免接触其他部位。
