磁共振是完全可以进行全身各个部位检查的，比如头颅，心肺，腹部和四肢关节等方面，例如CT可以发现脑外伤、脑出血、脑肿瘤、异常血管、脑萎缩等，可以检查胸壁、肺部以及纵隔的病变，对于肝脏占位性病变，以及全身骨骼病变都较其它的影像学检查方法更具有较大的优势。
怀孕期间可以进行核磁共振检查，因为孕妇有肥胖、羊水不足、胎儿已经进入盆内，或者是产前超声无法确认的情况。
可以为胎儿胃肠道和消化道的异常情况提供更多的补充资料。建议孕妇和家人不要害怕核磁共振会产生辐射，也不要担心会对胎儿的发育有什么影响。在怀孕的3个月内，胎儿正处在细胞的分化发育阶段，因此要避免做核磁共振。
女性月经期间是可以做核磁共振的。
核磁共振没有放射性,检查前确定身上没有金属类物品,避免导致危险。经期做核磁共振提前跟医生沟通,若带有节育环不建议做核磁共振,因为节育环是金属类的。做核磁共振不会影响身体,部分患者会因封闭的空间导致幽闭空间恐惧综合症,感觉窒息、呼吸急促,这类症状极少见,女性经期做核磁共振没有多大影响。经期注意饮食,保持生活规律,女性经期身体虚弱,要多休息，饮食要清淡为主,不吃辛辣、刺激的食物,注意经期间护理，避免导致月经不调等情况。若是经期做检查,建议先跟医生沟通，了解注意事项,避免检查对患者带来不的影响。
一般情况下，骨折可以进行核磁共振检查，前提是没有植入心脏起搏器和任何的金属材料，具体内容如下：
核磁共振检查会造成一定的风险，而且大部分的骨折都可以通过X光片来确诊。对于部分骨折，有一定的诊断难度，当要确定骨折的位置时，可以进行Ct扫描。除非是一些特别的病例，例如脊柱骨折，通常要通过核磁共振来确定椎管中有没有骨块占据，或者是硬膜囊被挤压。所以，对于有骨折的病人来说，骨折可以进行核磁共振检查。
在带节育环是可以做核磁共振检查的。因为节育环多数是塑料制成的。如果是金属的节育环，就不能做核磁共振检查，因为金属的节育环在做核磁共振的时候，可能会由于磁场的吸引而出现子宫腔内节育环的移动。
女性在备孕期间可以做核磁共振。对于备孕没有什么太大影响。在备孕和孕期间进行磁共振检查，不用担心磁共振会影响卵泡的质量，不用担心磁共振会影响胎儿的生长发育，做彩超如果发现胎儿异常的情况下也需要做核磁共振来确认胎儿的具体问题。所以不用担心。