吃南瓜子好的方法是用手剥着吃，不要用牙嗑，如果用牙嗑，大量唾液会粘在瓜子皮上而丢失。唾液除了具有湿润与溶解食物，使之易于吞咽，以及清洁和保护口腔的作用外，还有滋养肾精之功。牙龈萎缩，常吃南瓜子可以改变。
南瓜子食用简单，生吃或是放在锅里炒熟后再食用均可。吃南瓜子具有预防肾结石的功效。肾结石主要是因为钙起，而南瓜子中含有大量磷质，如果人们常吃南瓜子，吸收其磷质，就可防止矿物质在人的尿道系统凝结，使之随尿排出体外，达到预防肾结石的目的。
南瓜子有很好的杀灭人体寄生虫的作用，每天吃上50克左右的南瓜子，可以有效的预防前列腺方面的疾病，吃南瓜子可以杀死体内的寄生虫。南瓜子炒熟了之后吃，可以当做日常的零食，南瓜子里面还有维生素c，可以防止亚硝酸盐在消化道中转成致癌的物质亚硝胺，也可以预防食管癌以及胃癌，晒干的南瓜子是一位良药，能够缓解静止心绞痛。不管生吃或者是熟吃都可以。
可以炒食、煎汤、直接生吃或者研末食用，南瓜子生吃营养最好。生南瓜子作为大众健康食品不仅保证了南瓜子的原汁原味，而且使南瓜子的营养价值不易流失，生吃南瓜子人体更容易吸收其磷质，可以有效防止矿物质在人的尿道系统凝结达到预防肾结石的目的。
南瓜子可以生吃，但是多吃不易消化，会排较多肠气。生南瓜子有一定毒性，少量吃可以打虫，吃多会中毒。南瓜子晒干，熬水喝可以有杀虫的功效驱猪肉绦虫，蛔虫都是很有效的。
一般情况下，前列腺炎吃南瓜子可以，具体内容如下：
南瓜是一种可以补肾的食品。南瓜子具有治疗前列腺炎的功效，主要原因在于其中富含的微量元素锌，可用于治疗男性精子品质不佳、睾丸附睾炎、前列腺炎等病症，但功效不大，仅限于辅助。如果是前列腺炎，可以通过口服抗炎症的药物进行消炎，避免出现急性前列腺炎的情况，从而导致病情加重，从而降低生活品质。
