吃木瓜的注意事项有木瓜不能与海鲜一起食用，会导致腹痛头昏，引起食物中毒。也不能与南瓜一起食用，会降低营养价值。不能与油炸食物一起吃，会引起肠胃不适，严重的会导致呕吐，腹泻等症状的发生。
木瓜是有很好的美容功效，经常吃木瓜可以平肝和胃，舒筋活络，软化血管，抗衰养颜，丰胸减肥的功效，木瓜偏寒性，因此胃寒、体虚者不宜多吃，否则容易腹泻或胃寒想吐，畏寒体弱的孕妇不可食用。
木瓜含有17种以上的氨基酸和钙、铁，还含有木瓜蛋白酶、木瓜蛋白酶等。半个中等大小的木瓜足为成年人提供整整一天的维生素C，木瓜在中国被称为长寿水果，顾名思义，多吃可以延长寿命。适用于慢性萎缩性胃炎、产妇乳缺乏、风湿肌肉骨痛、瘀伤患者、消化不良、肥胖患者，但不适合孕妇。
可以减肥，木瓜里内含木瓜酵素，而青木瓜的木瓜酵素是成熟木瓜的二倍左右，这些木瓜酵素不仅可分解蛋白质、糖类，更可分解脂肪（其分解脂肪的能力可以说是木瓜最大的特色），通过分解脂肪可以去除赘肉，缩小肥大细胞，促进新陈代谢，及时把多余脂肪排出体外，从而达到减肥的目的。
木瓜属于一种低热量的水果，常吃木瓜也不会长胖，而且生吃木瓜对丰胸的效果也非常的好，虽然木瓜当中的热量比较低，但是木瓜当中的含糖量也比较高，所以在吃木瓜的同时尽量不要在晚上睡觉之前吃。
木瓜性寒，所以对于寒性体质的人，体质虚弱的人，有胃寒的人也不宜吃，因为这些人吃了木瓜后可能会引起腹胀，腹泻等症状，有些人可能会对木瓜中的某些成分过敏，在吃了木瓜之后可能会引起过敏性反应。