慢性结肠炎存在细菌感染，还应当根据病原菌选择敏感的抗菌药物进行治疗，常用的药物有喹诺酮类、氨基糖甙类等。临床上缓解症状最常用的药物是柳氮磺吡啶、美沙拉嗪等。如果慢性结肠炎出现急性改变，这时还可以考虑短期应用糖皮质激素，如地塞米松、泼尼松等。此外还应对症治疗，腹痛明显时可以应用山莨菪碱；腹胀明显时可以应用莫沙比利；腹泻明显时可以应用盐酸洛哌丁胺；便秘症状明显时可以用果导片等。
是指多种原因引起的结肠炎症性病变，可由细菌、原虫等生物引起，亦可由变态反应及理化因子引起，根据病因不同，可分为特异性炎性病变和非特异性炎性病变，前者指感染性结肠炎、缺血性结肠炎和伪膜性结肠炎等。后者又称炎症性肠病，包括溃疡性结肠炎及结肠克罗恩病。患者一般会有腹泻、腹痛、黏液便及脓血便、里急后重、大便秘结等表现，常伴有消瘦乏力等，多反复发作。
长期的慢性结肠炎经常会出现腹泻、便秘等症状，这是一种不典型的炎症，如果在做粪便常规的检查中没有发现任何的微生物。具体内容如下：
可以口服柳氮磺胺嘧啶来进行治疗，同时还要注意饮食，避免吃辛辣、生冷、油腻、刺激性的食品，要保持良好的心态，避免精神紧张，否则可能会加重结肠炎的病情。少吃含粗纤维、油炸或油炸性食品，比如鱼干、芹菜、豆芽、韭菜、腊肉。注意卫生，尽量实行分餐，避免共用餐具、水杯、牙具等引起幽门螺杆菌感染。
临床用药还应当正规合理，以最大限度的控制症状发作。如果慢性结肠炎存在细菌感染，还应当根据病原菌选择敏感的抗菌药物进行治疗，常用的药物有喹诺酮类、氨基糖甙类等，比如左氧氟沙星。临床上缓解症状最常用的药物是柳氮磺吡啶、美沙拉嗪等。
一般情况下，如果患有慢性结肠炎，患者会有便秘的症状，例如每天2-3次。大便特征也会发生变化，通常情况下大便很成型，而有些患者其是在直肠和乙状结肠，会有内急后加重的症状。除了大肠，如果患有慢性结肠炎，还可能引起肠易激综合症。患者会出现腹痛，大便次数增多，大便性质变化。如果患者在肠镜下没有发现肠壁上有炎症，那么就应该对症治些患者会在便血后进行排便，有些患者一日内大便5-6次不成型，可以改善肠道菌群，对症进行止血。患者可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如巴柳氮片、阿莫西林胶囊、甲硝唑片等。
慢性结肠炎，多半是之前存在肠炎，但是经过治疗并没有完全好，但是身体一直有点不舒服继而出现腹痛等大便异常的现象，而溃疡性结肠炎，除了出现腹痛，还伴有腹泻或是便秘交替出现，并且这个属于免疫性的疾病，治疗起来比较棘手，并且主要是通过免疫抑制剂以及肾上腺素控制的，而结肠炎就不一样主要还是消炎。