肠镜下切除息肉是比较安全的。如果息肉距离肛门位置比较远，只能选择在电子结肠镜下进行切除。比较小的，可以用活检钳直接夹除。对于比较大的，可以采用镜下的电刀烧灼，然后送病理学检查。
一般情况下，消化内镜下切除息肉的不良反应可能有出血、穿孔等。具体内容如下：
1.出血：消化内镜下切除息肉，由于会产生创面，因此在息肉被切除后，会出现出血的情况，但出血量通常比较少。
2.穿孔：如果消化内镜下切除息肉时，切除的面积过多，深度过深，且患者没有注意后续的护理工作，可能会导致出现穿孔的情况。
肠镜下切息肉手术之后，医师会针对不同病人的具体情况给予不同的注意事项。主要是根据息肉的大小、部位、数目，嘱咐病人绝食或者卧床、流食或者半流食等。息肉比较大的患者一般推荐卧床，绝食1-2天，息肉比较小的患者一般推荐绝食1天就可以了，如果是用活检钳钳住的比较小的息肉则推荐手术后半流食1-2日就可以恢复正常进食，如果息肉摘除之后在钛夹或者尼龙绳夹闭的辅助下，则推荐卧床，通常在1-2周之后再开始跑步健身游泳。
胃息肉以炎症性，增生性及腺瘤性息肉为主，镜下摘除者以腺瘤性或直径0.5cm以上息肉为主。一般镜下切除术后禁食1～3天，输保护胃黏膜和抑制胃酸分泌药物，平时7天即可达痊愈。
另外镜下切除易发生息肉反复发作，患者需要定期复诊，一般是6个月-1年复诊1次，以免漏诊息肉病变。术后患者要做好护理工作，避免损伤切口或辛辣刺激性食物。
单纯息肉切除息肉较小，小于1cm的息肉，患者可在术后2小时开始饮水，6小时后可以过渡到流质饮食，20多小时后可以普通饮食。如果患者肠镜息肉切除较大并选应全麻术式，患者需在术后6小时后可进水，24小时后可流质饮食，如果患者术后没有出现腹痛、腹胀、便血等情况，患者一般可在24小时后开始普通饮食。
进行肠镜切除以后，患者需要住院观察一周，并且要尽量卧床休息，不要有大强度的运动。此外还需要注意在术后一周内避免过度劳累或者是紧张、激烈的情绪，都是不利于病情康复的。