低位简单性肛周脓肿愈合时间较短，一般在1个月左右，高位复杂性肛瘘愈合时间相对较长，一般在50天左右。肛周脓肿术后保持大便通畅及肛周清洁，便后及时清洁换药，促进创面愈合。
肛周脓肿切开引流术入不彻底很可能会形成肛瘘，肛周脓肿手术后一般不会形成肛瘘，除非复发，一般肛周脓肿从手术到完全好需要3-4周，忌烟酒及辛辣刺激食物。不要劳累。可以进行身体锻炼。
创面一般还需要30-45天左右才能愈合。建议忌辛辣刺激饮食以及发物，清淡饮食，局部热敷理疗。肛周脓肿在一般的手术后可能会并发肛瘘的形成。怀疑是肛周脓肿手术后有肛瘘形成，建议及时到正规的医院肛肠科就诊，应该需要再次手术才能治疗好。平时要注意清理局部的卫生。
肛周脓肿术后需要连续换药治疗一个月，完全恢复两个月。因为术后伤口容易被粪便污染，这样会影响创面的愈合。其术后恢复时间主要是跟创面的大小以及术后换药有直接的关系。
避免挤压。保持肛周清洁卫生。多喝水，多吃蔬菜水果，忌辛辣等刺激性食物。治疗得当，保养得好，一般两周左右即可恢复正常。如两周后仍无恢复或病情加重，应到正规医院肛肠科检查就诊。
肛周脓肿手术之后，一般需要在医院换药一周左右。在每次换药时，都需要用棉签清理里边的脓。最怕是外边长好了，可是里边还是有脓血，这样有可能需要再次手术。出院一个月以内，建议每次便后都用水清洗，保持干净。一个月之后基本上就没有什么问题了。