血栓性痔一般多见于血栓性外痔，这种痔疮的治疗分为保守治疗和手术治疗。一开始，血栓性外痔会疼痛特别明显，如果未行手术治疗，可以先行温盐水坐浴并口服消肿的药物，同时口服止痛药，疼痛会逐渐缓解，痔核会消肿。最后退化为皮垂。如果急诊行手术治疗，直接将外痔连同血栓一并切除，术后继续坐浴和口服药物治疗。
可以保守治疗，即通过中药熏洗，活血化瘀，使炎症吸收，再涂抹痔疮膏于患处，通常见效需要一周时间。保守治疗多用于小的血栓。手术治疗多用于保守治疗无效的大块血栓。
血栓痔如果是在早期，可以口服消肿药物，局部涂抹痔疮膏，起到消肿抗炎的作用。早期在经过保守及药物治疗，有可能血栓被激化，从而越来越小，导致血栓痔的消失。首先要养成良好的饮食习惯，避免辛辣和强刺激的食物，保持大便通畅，避免大便干结，多吃新鲜蔬菜和水果，戒烟戒酒。
痔核比较大还会影响到排便，痔核脱出。肛肠科就诊检查，如果是痔疮引起的，建议使用温水溶液坐浴，软膏等来进行治疗，不要吃辛辣刺激的食物，不能着凉，还要注意肛周卫生。
血栓外痔是临床多发病，治疗上，目前常以手术切除或手术切开剥离血为主，病人痛苦较大。但以温盐水坐浴法治疗该病可获奇效，可使95%上的病人免受手术之苦。治疗期间忌吃辛辣和有刺激性的食物。
血栓痔疮中的血栓，如果直径小于1cm，在用药的情况下是可以吸收的，比如外用马应龙痔疮膏或者龙珠软膏，大便后用活血化瘀的中药进行熏洗、坐浴治疗。治疗期间保持大便通畅，饮食清淡，禁食辛辣刺激性食物，避免久坐、久蹲等。3-5天的血栓可以吸收，如果血栓超过了1cm，吸收的可能性不太大，可能需要手术进行剥离切除，根据专科检查情况对症治疗，以免延误病情。