肛瘘微创治疗的费用决定于其自身肛瘘的复杂程度。临床上肛瘘有多种类型，如简单型肛瘘和复杂肛瘘、高位肛瘘和低位肛瘘、单外口肛瘘和多外口肛瘘等。肛瘘越简单，其治疗过程就简单，治疗时间也短，治疗费用也低。肛瘘越复杂，其治疗过程就麻烦很多，治疗时间更长，治疗费用就明显增加。所以，微创治疗肛瘘，简单的肛瘘治疗费用在五千元以内，复杂的可能超过三万元。
肛瘘如果是比较轻微的肛痿程度，利用微创手术之后是可以将内口的位置顺利进行关闭，而在关闭之后就可以达到治疗的效果性，而如果是比较重的肛痿程度，微创手术未必就能够完全性关闭，甚至是关闭之后还会容易复发，所以想要选择微创手术，也是要看肛痿的程度性。
对肛瘘疾病进行微创手术操作，费用会相对比较高一些，大概是5000元-7000元不等。这是因为肛瘘微创手术操作，对肛门部位的创伤性比较小，伤口容易愈合，愈合时间也较短，但是手术操作难度相对大一些，所以费用会增高。
对肛瘘疾病进行微创手术操作，费用会相对比较高一些，大概是6千元-8千元不等。这是因为肛瘘微创手术操作，对患者肛门部位的创伤性比较小，伤口容易愈合，愈合时间也较短，但是手术操作难度相对大一些，所以费用会增高。
微创无痛的肛瘘治疗方法是通过直肠纤维镜进入到肛门里面，通过监视器，直接对内口进行微创电凝，使肛瘘的内口干结闭合，然后洗干净瘘管里面的脓液，这样以后大便后，粪便里面的细菌和粪水进不到四面的组织里面去，就不会形成感染，疼痛。肛瘘一般可以采取挂线或者是手术治疗，需要采取积极的预防，不要有思想负担，多保重粗纤维食物保持大便通畅。积极的预防，提高身体素质。