肛瘘手术后的创面一般是敞开的，术后需要换药，保持引流通畅，术后疼痛主要与手术的方式，创面的大小等有关，大部分术后一周左右会疼痛，以后随着创面的愈合，疼痛会逐渐减轻。术后每日熏洗坐浴，保持肛周清洁，减少大便对创面的污染。
二级疼痛。肛瘘大多采用拔线手术，术后要定期绷紧线，这主要是为了保持橡皮筋的作用，可以起到慢性切割、绷紧线时有疼痛症状，一般一个月后肛瘘手术后要用橡皮筋绷紧线将基本拉紧。
有些疼痛的，可能是肛瘘发炎或者是便秘，饮食方面等有关平时注意卫生，不喝酒，不吃辛辣有刺激性的东西，可以化验一下血液分析看看，看看有没有红肿，可以吃点消炎药看看。
术后会感觉到肛周疼痛。因为肛周皮肤是齿状线下方，属于体神经支配的区域，对疼痛刺激敏感，通常是可以忍受的。可以选择应用温盐水坐浴的办法，能够缓解疼痛，手术以后也应该积极进行静脉抗感染治疗。
肛瘘多采用挂线法，术后应定期收紧。这主要是为了保持橡皮筋起到慢性割伤的作用会出现疼痛症状。操作一个月后，橡皮筋会基本脱落。然而，如果有些病人肛瘘位置太高，时间可能会更长。
