肛瘘的术后一般需要住院10-15天左右，在住院期间大夫会给输预防感染、止疼、止血的药物，每天会清洗伤口、换药，一般术后15天左右没有明显的疼痛，这时候基本上就不影响正常的生活。根据创面的大小一般在40-45天左右的时间切口可以愈合，这时候肛瘘就可以完全治愈。
治疗肛瘘需要通过肛瘘切开挂线术，手术过程一般是在保护肛门括约肌功能的前提下尽量将瘘管壁以及内口外口处理干净。手术中肛门局部形成皮筋的挂线，术后随着皮筋的脱落，表明局部括约肌间断性的切割。皮筋脱落以后表明局部伤口基本恢复，还需要后期生长肉芽。
首先一定要多注意休息，避免过度劳累，尽量多卧床休息，定期的到医院复诊复查，给予相应的处置。同时一定要注意自己的饮食，不要吃辛辣刺激的食物，不要吃油腻大的食物，多吃青菜水果类食物，一定要保证大便通畅，每日药物坐浴。
肛瘘是常见病，临床可表现为肛旁有一硬结，伴反复脓性分泌物，肛门疼痛等症状。治疗宜行手术治疗。术后坚持每日换药治疗，直至伤口完全好。伤口好的时间要根据伤口情况。建议伤口恢复后再考虑正常上班。忌辛辣，忌酒，保持心平气和。
肛瘘多为化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等感染亦可所致。最佳治疗办法可以手术处理。通常术后需要半月到一月时间恢复，手术观察期间一定要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。