肛瘘的根治术指的是找到肛瘘的内口，将瘘管全部切开，根据瘘管与肛门括约肌的关系，肛瘘可以分为高位肛瘘和低位肛瘘两种，如果是高位肛瘘，一般主张采取肛瘘挂线疗法，而低位肛瘘可以采取瘘管切除手术。清淡饮食避免油腻或刺激性的食物，粗纤维饮食预防大便干结；定期排便术后正常进食，养成正常排便习惯预防大便干结。
肛瘘手术一般愈合周期需要一个月，一周左右就可以正常工作，需要每天大便后温开水坐浴，保持伤口清洁，每天换药一次就可以了。忌辛辣，忌酒，保持心平气和，要生活规律，清淡饮食，多吃蔬菜和水果。
首先一定要多注意休息，避免过度劳累，尽量多卧床休息，定期的到医院复诊复查，给予相应的处置。同时一定要注意自己的饮食，不要吃辛辣刺激的食物，不要吃油腻大的食物，多吃青菜水果类食物，一定要保证大便通畅，每日药物坐浴。
肛瘘手术包括肛瘘切除术、肛瘘切开引流术及肛瘘挂线术几种。肛瘘手术后换药可能出现不同程度疼痛，病情比较简单的肛瘘手术，伤口创面相对比较小，疼痛症状也轻，可以耐受。病情比较严重的肛瘘，可能有多个伤口和创面，换药时疼痛相对明显一些。
肛瘘手术后一般需要二周左右恢复。具体情况到就诊医院咨询，肛窦手术方式很多，需结合自身病情，制定具体的个性化手术方式。平时注意养成良好的生活习惯，饮食宜清淡有营养，多饮水，定时排便，每日排便后可用坐浴，保持肛门清洁。
肛瘘分复杂性肛瘘和单纯性肛瘘，单纯性肛瘘一般手术后一期可以愈合。复杂性肛瘘则容易复发。并且不止是一次复发，可能需要反复手术。平时饮食清淡一点，多吃蔬菜和水果，多喝水，不吃辛辣刺激食物，不喝酒，避免久坐，适当的运动。