西医上治疗现在没有太好的办法，中医在治疗溃疡性结肠炎的时候效果较好。可以减慢发作的次数，对症状可以起到基本的消除。如果是其它的直肠炎，通过积极治疗是可以。避免吃辛辣食物。
慢性直肠炎是一种慢性的疾病，因此所以在治疗的过程也是非常漫长的，治疗大概需要2个月的时间。要控制病情，不仅需要病人在医生的指导下，服用一些相关的药物外，在生活中的调理也是非常的重要，在生活中要保持清淡的饮食，注意睡眠的充足。
慢性直肠炎一般不会癌变。规律作息，规律饮食，吃早饭之前喝一杯热水，然后再吃几粒花生米，然后吃早餐，平时尽量多喝小米粥，小米粥有很好的养胃作用。平时尽量不要吃生冷刺激性食物，保持好心情，坚持一段时间后，慢性直肠炎的症状会逐渐改善。
这种引起原因可能是免疫性的如溃疡性结肠炎，也可能是感染性的如慢性细菌性痢疾，或者有可能是遗传性的如克罗恩病等，治疗很难有针对性的。应该进行肠镜检查，明确一下肠炎的类型，进行针对性的治疗的。
慢性直肠炎的治疗周期与病情和治疗方法有关。如果病情相对较轻，可以服用药物进行治疗。如果病人患有溃疡，需要高压氧治疗。还可以多吃山药、白扁豆和薏苡仁，它们具有健脾养胃的作用。
慢性直肠炎要治疗两个月-三个月，忌辛辣刺激高脂油腻饮食，虽然不吃寒凉的油腻难消化的食物就不会肚子疼，但是还是应该调理一下，让自己即使服用寒凉和难消化的食物也不会肚子疼。