脑部囊肿严重的，如果是一个单纯的囊肿，例如脑内的蛛网膜囊肿、松果体囊肿，这些囊肿一般不会引起患者的症状，可以随访观察，这种并不严重，对于一些表皮样囊肿，常常会引起患者的继发性三叉神经痛等。
脑囊肿通常指蛛网膜囊肿，由囊状结构形成，脑脊液被蛛网膜包围。通常，它们不会自动吸收。此外，服用治疗颅骨囊肿的药物效果不好。去大型公立医院的神经外科看看是否需要手术。医生将根据她的情况给出适当的检查和治疗计划，积极配合医生治疗，平时多喝水，多吃新鲜水果和蔬菜。
脑部囊肿严不严重，主要取决于生长的位置及其囊肿的大小。比如蛛网膜囊肿一般不会引起临床症状，主要是以随访为主，有些人终身不会引起颅内压增高的症状。如果蛛网膜囊肿引起临床症状，就是比较严重的，是需要进行手术治疗的。比如第三脑室胶样囊肿，因为其可以导致压迫第三脑室，引起梗阻性脑积水，从而引起颅内压增高的症状，是需要进行积极手术治疗，也是比较严重的。
囊肿增大的时候，可以出现脑局部的组织受压所表现出来的一些功能缺失，比如乏力、感觉障碍，囊肿比较大已经形成压迫症状，或者是一个颅内高压表现或者出现癫痫的状态，进行囊肿的手术干预，比如囊肿的造瘘术或者囊肿的低压分流手术。
脑囊肿主要根据囊肿的类型，囊肿的大小以及囊肿是否引起相关的症状来决定的治疗方式。对于没有任何症状的脑部囊肿，特别是脑部的蛛网膜囊肿，松果体囊肿等，一般们并不需要特别的外科治。
卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
