在早期乳管开始扩张时，有乳房胀痛，囊肿发展完成时疼痛消失。疼痛为持续性，在月经来潮前显著，月经后减轻或消失。乳腺囊肿的治疗方法，乳腺囊性病应以外科手术治疗为主，术前应明确病变部位，早期的乳腺囊肿切除为主，如有癌变则行乳房切除。
乳腺囊肿的治疗要分情况而定，如果症状较轻，不影响工作与生活时，可以用乳罩托起乳房，以缓解乳房胀痛，不用特殊治疗，可以定期到医院进行复查。如果症状较为严重时，应该及时采取手术进行切除，在手术之后，也应该做好乳房的护理，以免病情复发，可以适当的进行一些锻炼，增强自身抵抗力，可以起到病情恢复的作用。
多数乳腺囊肿无需手术治疗，乳腺单纯囊肿有自限性，经过3年或更长时间后病变可以自行停止。平时少吃油脂类食物，忌食生冷和辛辣等刺激性的食物，尽量避免使用含有雌激素的药物。
乳腺囊肿是由于体内的激素失衡导致上皮组织增生，患者长期的气滞肝郁也会导致乳腺囊肿，治疗方法都是采用药物治疗，情况比较严重也要采用手术切除的方法，患者平时日常生活中也要加强护理，尽量平稳自己的情绪。
乳腺囊肿可以通过手术或病理穿刺来治疗。
由于乳腺囊肿是乳腺的良性肿瘤。通过手术切除，是可以完整的切除，不会引起复发或其他病变。而穿刺治疗适用于不宜手术切除的病例，也是有治疗作用的。
建议患者在日常生活中注重个人的饮食，不要食用生冷、辛辣等食物，多吃新鲜蔬菜，饮食清淡，禁烟禁酒，注重锻炼，保持愉悦心情。
乳腺囊肿可以采用中医中药治疗，乳腺囊肿是慢性病，内分泌失调严重，病变组织对药物敏感性差，囊肿消失就慢，所以，中药治疗口服药物至少需要半年以上才能见效，治疗时间较长。