和扁平疣的区别就是他们的疣体是不太一样的，扁平疣一般是不突出来的，但是扁平疣是突出来的。如果说有平常疣的话，当地的正规医院进行物理治疗，可以配合做一些液氮的冷冻疗法，都可以，就是要注意个人的饮食，一般有疣体的话尽量不用吃刺激性的食物。
寻常疣和扁平疣都是由人乳头状瘤病毒感染所致皮肤病，主要区别在于表现不同。
寻常疣和扁平疣均有不同程度的临床瘙痒或烧灼反应，前者以皮肤出现大小不等的圆形或椭圆形浅表性损害为主，而后者则多表现为丘疱疹及斑块等皮损，二者的主要区别在于表现不同，寻常疣以相对凸起为特征，表面较硬、角化较明显的丘疹。
可应用药物、冷冻、电灼疗法、激光等手段治疗。
寻常疣、扁平疣都是由于人体乳头瘤病毒感染引起的，两者的类型不同，但都可以治愈。
扁平疣是扁平疣病毒感染引起的，目前只能对症治疗，主要以抗病毒调节免疫为主，扁平疣是疣状病毒感染的一种传染性皮肤病。该病以肉瘤为主要症状，但不会感到明显的疼痛。要注意局部的卫生，不要去搔抓，以免传染。可以先进行冰冻疗法，再继续应用诸如阿昔洛韦软膏等抗病毒药物。
不一样的，扁平苔藓是一种原因不明的慢性炎症性皮肤玻典型皮损为紫红色多角形扁平丘疹，常有口腔粘膜损害，精神紧张、病毒感染、免疫异常可能是本病的原因或易感因素，而扁平疣由人类乳头瘤病毒引起。
HPV会引起扁平疣，也会引起寻常疣，疣状表皮发育不良，以及宫颈癌等病变；这个病毒很顽固，目前并没有能直接杀死这种病毒的药，只能通过增强免疫力；但很多人用了很多增强免疫力的药照样没用的；原因是这个病毒本身具体伪装功能，能降低局部的免疫力，让人体免疫系统发现不了它。