甲状腺囊肿治疗主要依据甲状腺囊肿的肿物多少、大小来决定。较小甲状腺囊肿无需治疗，较大甲状腺囊肿或者短期内迅速增大的甲状腺囊肿。由于甲状腺囊肿多数是良性，手术切除之后，一般无需再进行其它方面的治疗。但是如果甲状腺囊肿较多，甲状腺组织也进行了部分切除，可能造成一部分病人甲状腺功能减低，术后还需配合进行甲状腺激素的治疗。
甲状腺双面叶出现囊肿，大部分是良性疾病。
结节性甲状腺肿导致部分分泌功能随着结节的增大，发生囊内出血，就会成为甲状腺两侧叶的囊肿。囊肿比较小，不用处理，定期观察即可。双侧叶形成大囊肿或囊室性肿瘤，如果出现压迫症状或有困难，应进行手术切除，必要时可穿刺吸囊液，减少症状。因此，出现双侧叶甲状腺囊肿的患者应到正规甲状腺外科或专科医生进行详细咨询和诊断，并选择适当的治疗方法，以消除或治疗甲状腺双侧叶的囊肿。
如果甲状腺良性囊肿是小鸡蛋大小，通常要手术。手术后要坚持吃药，甲状腺囊肿有良恶性之分，良性甲状腺囊肿都采用保守中医治疗，中医治疗也比较认同，只要及时去医院治疗，甲状腺囊肿是可以恢复的。
囊肿一般质地偏软，按压富有弹性，如果囊肿内部囊液比较多，张力比较大，也可以表现为质硬的包块，一般边界清楚。囊肿容易发生在肝脏、肾脏上，同时甲状腺结节以及乳腺结节也可以发生囊性变，卵巢也可以出现卵巢囊肿。
囊肿都不是恶性的，不是癌症之类的东西。宫颈囊肿需要物理疗法或手术治疗，到专业的医院做进一步检查，明确病情的性质，专家会为您制定一个合理的治疗方案。平时要注意休息，多喝热水。
通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
