小孩子早上起来咳嗽是由于呼吸道系统疾病刺激咽喉部或者支气管黏膜，导致痰液增多引起的反射性咳嗽症状。从咽喉部小支气管，呼吸道粘膜受到刺激以后，这些炎症感染或者是其他胸膜性疾病，胸膜受刺激也会引起咳嗽，或者是其他循环系统心血管疾病，以及中枢性的因素，大脑皮质直接影响咳嗽中枢出现咳嗽，要根据咳嗽的性质以及咳嗽时间，一般多数是属于呼吸道急性炎症，或者是过敏性因素异物吸入所引起的急慢性咽炎。
是一种正常的生理防御反射，偶尔咳一两声是正常的生理现象。早上天气比较凉，儿童刚起床受到寒冷空气的刺激，支气管会发生痉挛而引起咳嗽，还有经过一夜的睡眠，呼吸道里存在一定的分泌物。
宝宝每天早上会咳嗽原因有呼吸道受感染，鼻腔粘膜有炎症，支气管出现痉挛等。宝宝的支气管会出现痉挛，一般是因为感冒，流感等病毒感染，或者是因为细菌感染。可以在日常生活中和小孩一起煮一些雪梨水，加入一些冰糖，可以起到润肺的作用。平时要多给宝宝多吃一些容易消化的食物，还要注意保暖，都可以起到缓解咳嗽的作用。
宝宝的情况有可能是急性咽喉炎，可能是由于上火造成的，可以口服消炎败火的药物治疗，比如头孢氨苄颗粒，小儿咽扁颗粒等。建议找儿科医生面诊检查咽喉部，可以明确诊断，要清淡饮食，多喝热水，多吃蔬菜和水果，忌辛辣食物，注意保暖，避免着凉受风，外出时戴口罩。
可能与孩子呼吸道病毒或细菌感染有关系，导致感冒或支气管炎的发生。也可能鼻炎所致，是需要进行积极的治疗的。可带孩子到医院儿科就诊，进一步检查明确病因及病变程度，然后采取合理的治疗方法。
醒来就咳嗽的现象还是比较常见的，最常见的原因还是发生了呼吸系统感染，在晚上睡觉的时候人体的咳嗽中枢会受到抑制，所以咳嗽的现象就会减弱，会出现睡着不咳嗽，醒来的时候就会出现咳嗽。