不会太痛苦。肺穿刺活检首先作常规的肺部CT扫描，然后在CT图像上测出穿刺点到预定穿刺目标的距离和角度，穿刺点常规皮肤消毒、铺巾、局部麻醉。测量好穿刺深度，令病人屏气，按照预定角度进行穿刺。
肺部穿刺活检对于常人来说是会有一点痛苦的。针在体内时，让病人平静呼吸，尽量避免咳嗽。穿刺完毕退出穿刺针，穿刺标本固定，送病理检查。尽量采用与地面平行或垂直的方向，穿刺到位后，进行CT局部扫描，确定针尖是否在病灶内，若需要调整方向，要把穿刺针退到胸壁再进行调整，或者拔出重新穿刺。
大多数人在前列腺穿刺不会出现明显的不适。穿刺针非常细，对前列腺的损伤非常小。穿刺主要经过直肠，被检查者会出现肛门不适。在到达前列腺时会感到疼痛，但穿刺速度都很快，能够耐受。做穿刺前会使用局麻药物进行麻醉，还会对直肠进行浸润性麻醉，因此造成的不适感非常小。
前列腺穿刺活检时基本上只会有不适感，没有什么痛苦。
一般来说，做前列腺穿刺的患者都只会产生些许不适感，且活检时并没有什么产生痛苦感。那是因为活检时用的都是很细的针，穿透直肠等器官时并不会产生什么痛感，只会让患者产生些许的不适，都在忍受范围内。而且在做活检前都会使用利多卡因凝胶等局麻药物来进行麻醉，使患者的神经敏感度减弱。
肺癌穿刺活检一般是不痛苦的，因为属于局麻操作，先打麻醉药，局部没有疼痛感觉才穿刺进针。一般是在后背肋间隙的地方穿刺，术前需要先做CT定位发现占位病灶，然后选择合适的层面穿刺。
