通过了支气管镜检查是正常的情况下也不能完全排除患上肺癌的可能性，支气管镜发现肺癌也是只能发现中央型的肺癌，周围型的肺癌无法光通过支气管镜发现的。所以想要确诊肺癌则需要进一步进行穿刺活检。
可以检查的，纤维支气管镜可以提高肺癌的确诊率，尤其是对管内增殖型及管壁浸润型，可以采集样本做病理诊断，明确诊断。可以对肺不张的病因鉴别有极大的帮助，引起肺不张的病因有肿瘤、炎症、结核、出血、异物及外伤等。可以通过纤维支气管镜冲洗细菌，结核培养，对肺部感染提供病理学诊断。
支气管镜不仅可以直接观察病变部位，还可以采集细胞和活体碎片进行相关的细胞学检查，因此，支气管镜是检查支气管和肺肿瘤的重要方法，无论肿瘤是良性还是恶性，都可以通过支气管镜检查发现，因此支气管镜检查可以发现肺癌。
肺癌分为周围型肺癌和中心型肺癌，如果是中心型的肺癌侵犯纵隔淋巴结，或者肿物已经侵犯到支气管内，或者支气管内原发的肺癌，这时做气管镜，可以在气管内看到肿物，可以行病理组织活检，从而送病理，确定肺癌的病理类型。周围型肺癌是在肺的边缘周边部分出现的占位，这时做气管镜检查是看不到肿物的，除非肿物已经多发转移，转移到支气管。
肺癌主要生长在肺部的恶性病变，分布在气管、支气管上，而支气管镜检查时可通过气管或支气管到达病灶部位，采用一些相关技术获取病变组织，最终得到病理学诊断结果，而病理学诊断是确诊肺癌的金标准。