引起喝水呛咳的原因有很多，如喝水过急过快，咽部疾病，如咽炎、喉返神经病变，吞咽机制受损，呼吸系统疾病，如气管炎，气管粘膜炎性改变，粘液分泌增多，导致饮水呛咳，中枢神经系统疾病，如脑炎、脊髓灰质炎、脑干炎、中风后遗症等，消化系统疾病，如食管炎、食管癌等均可出现饮水呛咳。若喝水呛咳不是偶然发生的，要提高警惕，积极寻找病因。
呛咳属正常的生理反射，进食时受刺激可出现呛咳等情况，实际为气道自我防御机制，异物进入气道以后，气道自我防护将异物清除出现呛咳表现，但反复出现呛咳，需考虑其他疾病。
孩子经常咳嗽，可能与身体发育不完善、动作不协调有关。
有些宝宝的母亲奶量非常丰富，如果宝宝在吮吸的过程中，很容易吸入大量的奶水，如果没有及时的吞食，就会发生呛咳，此时要注意控制母亲的奶速和奶量，不要用力过猛，这样可以缓解咳嗽的症状。宝宝从生下来开始就开始咳嗽，而且咳嗽比较剧烈，而且一次又一次，需要去医院做检查，以确定是否存在腭裂，一些看不见的腭裂很难被察觉，只有在哺乳的时候，会发出咳嗽声。
小儿发生呛咳主要是因为喉咙发炎，也有可能是因为进食等原因造成的。具体内容如下：
喉咙发炎引起的咳嗽，可以口服金银花颗粒、利巴韦林颗粒、蒲地蓝口服液等。在这个过程中要注意多饮水，同时要保证房间里的空气相对湿度在60%左右，尽量不要暴露于被动吸烟。
家长可以给患儿早上用冷水洗脸，晚上用热水泡脚，长期坚持可促进血液循环提高身体抵抗力。
婴幼儿进食呛咳主要是因为婴幼儿的消化系统不健全，或者是进食时的不恰当。
婴儿在哺乳过程中会发生呛咳，主要是由于哺乳方式不当，乳汁会直接流入气管，造成剧烈的呛咳；其次，由于胃部的容积较少，食管和食管的括约肌还不发育，无法充分关闭，乳汁会倒灌到食道中，此时婴儿在吸气的时候会发生呛咳。
如果孩子经常吃牛奶呛咳，可能会出现一些先天性的发展结构不良，比如胃食管反流、肺炎等。
宝宝总是呛咳可能与饮食习惯和喂养姿势不争取有关。
宝宝经常会有呛咳的症状，通常都是因为进食和饮水过快，或者姿势不对造成的。如果长期存在这种症状，说明孩子可能患有食道气管瘘。此时应及时就医检查，以明确病因，对症治疗。
平时要养成一个好的哺乳习惯，最好是到正规的医院进行一次全面的体检，同时要注意宝宝的心情，不要过于焦虑。