儿童矮小症的治疗一种是营养方面的治疗，进行营养评估，加强营养；还有一种是打生长激素，打生长激素有一定的风险，要进行一些化验、核磁的检查；还有一种是中医、中药的治疗，现在营养加强同时，用微量的生长激素。
矮小症主要是因为宝宝本身性激素、生长激素等缺乏分泌。通常会导致患儿身高变矮，同时还会伴有身体其方面的问题。可采用注射生长激素的方法进行治疗。生长激素有促进生长发育的作用，对婴儿来说也很重要。生长激素剂量以儿童体重为基准，也有国产与进口之别，应该把婴儿带到正规医院儿科去，请专科医生认真为婴儿检查，清楚地了解宝宝的具体情况，进而给予正规，有效地治疗。
矮小症儿童生长缓慢，多数孩子食量较小，食谱相对丰富些更好。
饮食上要注意平衡饮食，荤素搭配，粗粮和细粮摄入均衡。孩子处于生长发育期，所需营养素很多。建议多吃蛋白质含量丰富的食物及维生素含量丰富的食物。建议一天一袋牛奶，一个鸡蛋，荤素适当搭配。多吃蔬菜、水果，保证维生素的摄入充足，适当补充微量元素，不建议补充太多营养品。要多进行体育锻炼，保正睡眠时间，养成良好的生活习惯。
遗传矮小症有一定的治疗手段，但是作用比较小。
对于遗传性的矮小症，一般没有较好的方法来治疗，可以通过使用药物和日常护理来缓解。建议在日常生活中注意休息，保证充足的睡眠，饮食中富含营养，最好是加强锻炼，平时多晒太阳可以有利于补充身体的维生素D，维生素D对钙的吸收来说是必不可少的，然后多吃一些含钙的食物，帮助骨骼生长。必要的时候可以前往医院进行生长激素药物的注射，部分患者也是可以达到普通人的标准身高的。
中医对于治疗矮小症有一定的效果。
矮小症有可能是由于脾肾亏损、气血不足导致的，所以要注意平时的生活要均衡，平时要注意饮食。尤其是小儿病人，其与父母的膳食安排有密切的联系。因此要根据具体的病因来进行调理，适当的中成药是可以的。矮小症是因为肺、肾两亏所致。可以选择服用补肺汤和河车大造丸。如果因为是因为肝肾阴虚，所以可以用大补阴丸加减中药方来治疗，中医可以治疗矮小症，也可以起到缓解的作用。
