清除牙结石有很多方法，1、牙周龈上洁治。就是洗牙，在超声波的震动下使牙龈上面的牙石与牙体表面分离去除牙石。2，龈下超声刮治。龈下超声刮治机器伸到牙龈下面清除牙根方向的牙石。3，龈下刮治根面平整。手动刮治器刮除龈下牙石烂肉腐败的牙周组织，使健康的牙龈贴在牙齿表面形成新的附着。
通过牙周洁治，能够去除龈上牙石和部分龈下结石，再用手动刮治的方法，去除龈下剩余少量结石，牙结石即可清除干净。全口洁治后牙齿较敏感，1-2周内不能吃过热过凉食物，以免受到冷热刺激。
去除牙结石的最重要的方法就是利用超声共振，并不是简单、暴力的机械性去除牙结石。牙体组织和牙结石密度不一样，物质不一样，在超声波产生的振动下，牙结石和牙体组织同时发生振动，当两个物体振动频率不一样的时候，自然就会慢慢的脱落。
牙结石自己处理的情况下就是通过刷牙漱口清除。牙结石初期是比较好处理，但如果不及时清洁就会钙化变硬通过刷牙很难清除，如果个人牙结石比较重的情况下一般不要自己的轻易处理应该去正规医院口腔科进行洁牙处理，通常通过洗牙来处理牙结石，现在洗牙是也是一种比较普遍的爱护牙齿的习惯。
洁治术是去除龈上菌斑和牙石最有效的方法，能够消除局部刺激，使牙龈的炎症完全消退或者明显减轻。龈下刮治术，是用比较精细的龈下刮治器械，深入牙周袋内，将根面上的牙石和菌斑去除掉。在做龈下刮治时，必须要同时刮除牙根表面感染的病变牙骨质，并且要使嵌入到牙骨质内的牙石和毒素也要去除掉，也称为根面平整。