治疗口腔念珠菌病可以服用抗真菌药物进行治疗，也可以用小苏打水与抗真菌药水交替漱口，真菌的治疗时间比较长，因此必须要有耐心，注意需要巩固治疗，以免造成复发。避免吃刺激口腔的东西。
治疗可选择局部药物治疗：使口腔成为碱性环境，可阻止白色念珠菌的生长和繁殖。抗真菌药物治疗：可以口服药物，注射液漱口，可以将药物研磨成碎末，涂抹在感染的口腔黏膜。
白念珠菌是一种卵圆形的芽生酵母。
在培养基、组织和分泌物中都会出现假菌丝，这种细菌是革兰氏阳性的，直径2~3μm*4~6微米，伸长的芽生细胞很像菌丝，所以被称为假菌丝。对于健康的携带者，唾液中的细菌含量在200/ml以下，所以常规的镜检方法无法检测到细菌，因为白色念珠菌对口腔粘膜的粘附力很强，是导致细菌感染的"立足点"，这种粘附力依赖于表皮细胞表面的甘露糖苷蛋白，从而起到粘附力的作用，从而可以有效地破坏糖类或类似结构的物质。
口腔念珠菌病主要危害口腔健康。
1.念珠菌性口炎主要有急性假膜型念珠菌口炎，该病但以新生儿最多，发病率为4%，又称新生儿鹅口疮或雪口病。早期粘膜充血，呈现鲜红色和雪白的反差；陈旧的粘膜充血减少，白色斑片呈淡黄色。斑片附着不紧密，稍用力就能擦掉，暴露红色粘膜糜烂面和轻度出血。患儿烦躁、啼哭、哺乳困难，有时有轻微发热全身反应。少数病例可蔓延至食道及支气管，造成念珠菌性食管炎或肺念珠菌病，少数患者亦可并发幼儿泛发性皮肤念珠菌病及慢性粘膜念珠菌病.
口腔念珠菌病的治疗是肯定要使用药物的，口腔念珠菌病主要是真菌在口腔内的感染，多发生于长期使用抗生素而抵抗力比较弱造成的口腔菌群的失调，导致真菌增生。可以用碳酸氢钠漱口，一般是在百分之3左右，通过药水交替的漱口抑制真菌的感染，从而治疗真菌感染。
诊治口腔念珠菌病的费用是2千-3千元左右。口腔念珠菌是属于真菌感染，需要自己注意一下饮食结构。不要吃一些甜食，不要胡乱使用抗生素，这些都有可能会出现病情反复。