可用以下方法治疗。对症治疗：对5至10岁的腭裂患者，实施在腭裂整复的同期行华西咽后壁增高术，以助腭咽闭合率的提高。手术治疗：利用咽后壁组织瓣增加软腭长度，利用咽侧组织瓣缩小咽腔宽度，以改善腭咽闭合。动脉岛腭瓣手术治疗：大多选择在患儿3-6岁之前进行治疗。唇裂修复手术治疗：一般单侧唇裂修复手术在患儿3-6个月进行，而双侧唇裂手术多在6-12个月左右进行。
主要病因有：母亲怀孕早期感染流感病毒、风疹病毒；遗传因素；怀孕期间服用镇静药、抗癫痫药、激素类药或大量接受X线照射等。主要表现为出生后上唇和上颚裂开成两瓣或三瓣，唇裂手术时间为生后3个月。腭裂为生后18个月。
采取对症疗法：对腭隐裂的患儿应该严密监护，只有当出现喂养、听力或语音问题时才考虑进行腭裂的修复。或者用改良兰氏术医治：在松弛切口内扪出钩突，用凿将钩截断，使在钩突上面滑行腭帆张肌失去紧张软腭的能力；用一弯剪自裂隙切口插直硬腭后缘，使软硬腭分离；最后将两个粘骨膜瓣，仔细缝合。
用改良兰氏术医治：在松弛切口内扪出钩突，用凿将钩截断，使在钩突上面滑行腭帆张肌失去紧张软腭的能力；接下来用一弯剪自裂隙切口插直硬腭后缘，让软硬腭分离；最后将两个粘骨膜瓣，仔细缝合。对症治疗：对腭隐裂的患儿可严密监护，只有当出现喂养、听力或语音问题时才考虑进行腭裂的修复。
唇腭裂的治疗主要是通过整形来恢复口腔内的结构以及面部的畸形。但是选择什么样的手术方式以及手术时间还需要根据唇腭裂的轻重程度来考虑。最终的治疗目的是改善腭裂，恢复软腭的生理功能。术后还需要进行语言的训练来形成正确的发音。长大一些还需要到口腔科进行牙齿的矫正治疗。
可用以下方法治疗。腭裂整复手术：利用裂隙邻近的组织瓣封闭裂隙，延长软腭，将错位的组织结构复位，以恢复软腭的生理功能。对症治疗：唇裂修复和腭裂修复的时间不同。唇裂通常可以在宝宝两三个月时通过手术进行修补。手术治疗：利用咽后壁组织瓣增加软腭长度，利用咽侧组织瓣缩小咽腔宽度，以改善腭咽闭合。也可用改良兰氏手术治疗。动脉岛腭瓣手术治疗：大多选择在患儿3-6岁之前进行治疗。