病因并没有十分的一种明确。可以每到3-6个月来进行一个彩超的复查，如果这种囊肿有明显的增大，或者是有压迫症状，要考虑手术的一种治疗方式。这样才能使其恢复到一个正常的状态。
甲状腺滤泡囊肿是甲状腺囊肿的一种，与内分泌紊乱或炎症刺激有关。通常为巨大的包块，临床较易发现，会压迫气管、食管及神经，引起咳嗽、吞咽困难、声音嘶哑等症状。甲状腺滤泡囊肿对称圆形，一般不疼或轻微疼痛，多数是单发，少见多发，囊内压力不高。甲状腺滤泡囊肿生长缓慢，病程较长，对甲功影响不大。部分滤泡囊肿可以发生癌变，需要早起手术治疗。
甲状腺双侧叶滤泡囊肿，一般指甲状腺含液体囊肿，肿块圆形光滑，一般不痛，可随吞咽上下移动。
甲状腺囊内压不高时，质软，液体多时，质韧。通常囊肿无明显症状，除囊肿大或囊肿内存在出血外，均可引起疼痛、吞咽困难、呼吸困难、声音嘶哑等压迫症状。甲状腺囊肿多为良性，如无明显压迫症状，一般无需治疗，定期观察即可。如有明显压迫症状，可在手术切除或抽取囊液。
真正的甲状腺滤泡囊肿，要根据肿瘤的性质及组织分类进行特异性治疗；如果是恶性肿瘤，要应根据肿瘤分期选择不同的治疗方法，常见有手术切除等；可通过手术加其他治疗方法进行治疗。
甲状腺双侧叶滤泡囊肿通常不严重。
甲状腺双侧叶滤泡囊肿是常见的甲状腺疾病，多由炎症刺激或体内激素代谢紊乱引起，是良性病变。若患者检查发现滤泡样囊肿且囊肿较小，可进行观察，每年复查彩超。囊肿增大，超过4厘米，有压迫症状，引起声音嘶哑，可考虑切除手术。滤泡囊肿一般提示良性的病变。.如果囊肿比较小，暂时不需要手术，定期随访即可。
甲状腺多发性滤泡囊肿原因：
1、内分泌紊乱：内分泌紊乱可导致身体激素水平异常，甲状腺激素升高，长期生气、压力过大易引起肝气郁结，引起内分泌失调，引起甲状腺多发性滤泡。患者未出现不适症状，可定期去医院复查，出现不适症状，可采用甲状腺激素等药物治疗；
2、慢性炎症刺激：自身免疫系统异常引起的疾病，患者可出现激素水平下降等现象，导致甲状腺功能减退，引起甲状腺多发滤泡囊肿。若患者出现呼吸困难、吞咽困难及声嘶等症状，应立即进行手术治疗，包括穿刺引流或手术切除等，否则可能导致永久性失声等。