早晨口臭是由于经过夜间一夜的细菌发酵，口腔内的细菌含量会增加的特别多，细菌产物也会特别多，在早起的时候就会有轻微的口臭，只要经过正常的刷牙漱口就可以去除掉。存在牙龈炎、牙周炎或者龋齿的患者，在早晨起床之后口臭就会特别严重。
早晨口臭可能与口腔和胃肠道疾病、鼻咽部的疾病、呼吸道疾病等都有可能有关联。吸烟、饮酒、喝咖啡，以及经常的吃葱、蒜、韭菜等辛辣刺激的食物，或者是嗜好臭豆腐等具有臭味食物的人，也容易引起口臭。此外，晚上如果吃得过饱，吃得过于油腻，或者是辛辣刺激性的调料，也会导致早晨有口臭的问题。
饥饿、食用了某些药物或洋葱、大蒜等刺激性食物、抽烟、睡眠时唾液分泌量减少所致的细菌大量分解食物残渣等都可能引起短暂的口臭。而健康人的口臭可能由于不良的口腔习惯和口腔卫生造成舌背的菌斑增多、增厚所引起。平时养成良好的饮食卫生习惯，多吃蔬菜水果。
口干、口臭主要是因为有口腔中的病菌。
患有龋齿、牙龈炎、牙周炎、龋齿、牙周炎等的人。患者的嘴巴里很容易滋生大量的微生物，特别是厌氧微生物，会分解生成一种散发着恶臭的物质。如果体内缺少了维生素B2，就会出现口腔溃疡、咽干、舌体溃疡等情况。
平时要注意保持牙齿的卫生，最好是一天两次刷牙，同时要注意保持牙齿的清洁。可以用来做离体实验来确定病人的主要病因，然后选择具有抑菌力的漱口液进行局部的抗菌处理。
早晨起来口臭考虑是胃肠道疾病、鼻咽部疾病有关，吸烟、饮酒、喝咖啡等都会引起咳嗽的现象发生；此外如果晚饭吃得过饱或者是吃了过多的肉、油腻的食物或者是刺激性的调料也会导致口臭的现象发生。