关键是看脑炎发病期间对大脑的损害程度，有些大脑的损害辅助检查是看不出来。如果现在没有明显的脑损伤的症状，以后是不会再发生后遗症的，但是有些可能暂时不能发现。
脑炎的后遗症主要有：1、脑炎累及人体运动神经，引发运动功能障碍，导致四肢无力、活动能力受限的后遗症；2、脑炎发病部位本来就属于大脑，因此更容易损害大脑神经引发智力障碍；3、疾病累及语言神经，引发失语后遗症；4、眼球麻痹也是脑炎的后遗症之一，由于这种疾病也容易让视觉神经受损；5、脑炎也容易引发肌肉萎缩的后遗症。
严重的脑炎是会有一些后遗症的。脑炎主要是指脑实质受病原体侵袭导致的炎症性病变，会引起发烧，头痛，恶心，呕吐等症状，其后遗症与治疗有一定的关系，与住院时间没有关联，主要是看疾病的康复程度来判断有没有后遗症状。
一般来说，脑炎的后遗症症状主要有：发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥等，甚至还会影响到大脑、丘脑下部等。
有些患者会出现兴奋多语、烦躁、哭笑无常、行为异常、失眠、记忆力减退、大小便失禁等症状。除此之外，智力下降，大脑迟钝，眼睛发麻，吞咽困难也会偶热如出现。严重的患者会出现癫痫性头痛、抽风、四肢抽搐等症状。
脑炎后遗症的症状轻重不一，主要表现为神经精神方面的异常，神经异常的表现多有，发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥。重者则大脑丘脑下部底节脑干小脑和脊髓的症状都可能有异常表现。
