症状表现为耳鸣，心慌，消化不良，月经不调，头晕，头痛，恶心呕吐，眼花，胸闷气短，腹胀便秘，出汗，遗精，阳痿，肢体震颤等一些症状，神经系统症状常见的有头晕，头痛，失眠多梦，记忆力减退等。
心脏神经官能症无器质性心脏病证据，临床上可能会有早搏的，常见的症状是心悸、胸痛、胸闷，胸憋、气短，同时伴有失眠、烦躁、紧张、焦虑压抑等。确诊病因后，在医生的指导下进行用药和治疗，平时注意养护，保持心情愉悦。
胃神经官能症表现以胃肠道症状为主，比如胃脘胀满，胃内不适感，反复的恶心、呕吐、反酸以及胸闷或者是咽部有异物感，胸腹部会有颤抖一样的疼痛，没有饥饿感，进食以后上腹部饱胀等症状。
咽部神经官能症会感觉到自己咽喉部位有疼痛感、闷塞、狭窄的感觉，而且患者女性多于男性，是和精神因素有关系的，比如癔症、神经衰弱等疾病，可以通过心理疏导的方法进行治疗。
胃神经官能症的症状多表现为反复发作的连续性嗳气，咽部异物感，两肋和胃脘部的胀闷、串痛，及胃内无以言状的不适感，无饥饿感或时而食欲旺盛，时而无食欲，每遇情绪变化则症状加重。而且各种胃肠道检查无明确疾病，比如胃肠镜正常，超声正常等。治疗主要以神经调节为主。
肠道神经官能症和平时的生活习惯，精神状态有一定的关系，有的人属于平时压力比较大，精神紧张，熬夜，容易出现肠道神经官能症的症状，主要表现为腹痛，腹泻，恶心呕吐，有的人会出现腹泻和便秘交替。