在婴儿期会出现明显的症状，常有发绀、呼吸急促、多汗，喂养起来比较困难，患儿不容易配合，体重往往没有明显的增多。平时经常会感冒、发烧，甚至发生肺炎。随着年龄的增长，艾森曼格综合征的病人会出现明显肺动脉压力增高。当患儿肺动脉压力增高以后，在活动时会出现明显的呼吸困难、活动受限，身上出现青紫。
症状会有，意识改变。可以表现为昏迷，对外界刺激没有反应。脉搏细速。可以表现为脉搏的增快，而且脉搏微弱。尿量减少，皮肤湿冷发绀等症状。血压下降也是休克的一种表现，但是不能作为判断休克最主要的指针。
感冒症状有鼻部症状，如打喷嚏，流鼻涕，特别是流清鼻涕；也可以出现咳嗽，咳痰，咽干，咽痛，咽痒，咽部烧灼感等咽部症状；还有味觉减退，呼吸不畅，声音嘶哑等症状。有的会有发热，全身不适，畏寒，头晕，头痛，四肢无力，关节酸痛，全身无力，恶心，呕吐，食欲减低，体重降低，腹泻，腹胀等全身及胃肠道症状。有的还会有淋巴结肿大，扁桃体肿大。
肺炎的症状主要表现为呼吸道症状，同时还伴有全身性的表现，最主要的是呼吸道症状，就是咳嗽、胸痛、气短以及胸闷部分的患者，还会出现痰中带血的现象，严重的还会出现发热，如果出现高热的情况高达38.5以上，那么此时可能会出现肌肉酸痛、食欲不振以及头痛的情况，此时需要在医生的指导下选用合适的抗生素药物和消炎类的药物治疗，这样才能够加快病情恢复。
肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
肝损伤症状有食欲减退、肝区不适、腹胀、恶心、乏力、失眠、腹痛、面色苍白、头晕、休克等。肝外伤是腹部外伤中较常见而严重的损伤，其发生率仅次于脾破裂而居第2位。其中严重肝外伤的伤情复杂，并发症多，病死率高。
