抗病毒制剂，针对单纯疱疹病毒、水痘病毒及巨细胞病毒已有有效的抗病毒制剂可以选用。对于有免疫功能缺损的患者，则有必要较长时间使用。一些病情较重或免疫低下的患者，应酌情应用干扰素。
治疗上采用的办法是进行口服药物加上食疗来进行治疗。确定好患者患病的原因是什么，然后进行抗生素药物的口服治疗，这样就可以很好的缓解病情，后期再加上饮食上注意多吃一点高蛋白的食物。
保守的治疗方案可以采用中药加上西药的办法进行治疗。首先医生知道患者患病是因为什么原因导致的，然后进行西药的静脉注射治疗加上口服一些西药进行缓解。病情带稳定之后，用中药进行缓解。
脑炎是脑细胞发炎，脑炎通常由病毒感染引起，有少数病例的脑炎是由诸如流行性腮腺炎，或传染性单核细胞增多症，单纯性疱疹病毒等传染性疾病所引起．有少数一些脑感染并非由病毒所引起。应该积极治疗，控制住体温，保证水电解质的供给，使头肩部抬高15-30度，降低颅内压。应及时观察宝宝的神智以及意识的变化。给予高蛋白，高热量，高维生素的食物。保证室内安静。
应该加用抗病毒的药物。采用输液和休息疗法。因为脑膜炎是传染性的，所以将会被放到隔离房间至少48小时。如果因为脑膜炎对光敏感，住的房间将被弄暗。这时应摄取大量液体并服用药物以减轻发热和头痛。需要给病人感染的鼻窦部和乳突导流进行手术以防止再度感染。
一般治疗。保持呼吸道通畅，维持呼吸、循环功能；充分营养供给，保持水电解质平衡，纠正酸碱代谢紊乱，昏迷患儿可鼻饲或静脉营养，要注意褥疮护理。必要时气管插管、机械通气。
