引起间歇性癫痫发作的原因有很多，常见发病原因包括先天性疾病，产前期和围生期疾病，高热惊厥后伴癫痫发作，颅脑外伤，颅内感染，颅内肿瘤，脑血管病，中毒和营养代谢性疾病等。
导致间歇性癫痫多是颅脑外伤，脑血管疾病，感染，肿瘤中毒等，进而使下丘脑病变，发生周期性发作的植物神经功能紊乱，因为引发间歇性癫痫的病因不同，所以在治疗上也会有不同的治疗方法。
癫痫的原因很多如：颅脑疾病如脑肿瘤，脑血管病，颅内感染等。遗传。环境因素。脑损害与脑损伤。精神因素等不同病因。所引起，脑部神经元高度同步化，异常放电。有不同症状和体征组成的发作性，短暂性，通常也是刻板性的，临床现象称为癫痫发作。
间歇性癫痫是一种由不同病因引起的下丘脑病变导致的周期性发作的植物神经功能紊乱的综合征，在国际癫痫分类中未定为一个独立的类型，此癫痫病的症状多数为单纯部分性发作，通常具有以下特点：脑电图可出现痫性棘波等异常放电；部分病人发现下丘脑或者第三脑室底部病变；反复发作自主神经症状，每次发作具有相对刻板性；可有癫痫家族史。本病临床上易误诊为椎基底动脉供血不足。
癫痫的发病原因有好多，例如遗传因素，专家表示，癫痫分为两种类型，一种为原发性癫痫，另一种是继发性癫痫，前者是遗传因素，在其脑损伤和脑损害都可以引发癫痫，当人们大脑受伤以后，会在神经元放电异常的现象从而导致脑外伤癫痫，还有一种是环境因素引发的，由于人们不注意自己的生活习惯从而引发癫痫。
间歇性癫痫的脑病并无可以解释症状的结构变化或代谢异常，而与遗传因素有较密切的关系。症状性癫痫，多发生于脑部病损和代谢障碍后，如先天性疾病、产前期和围生期疾病(产伤是婴儿期癫痫的常见病因)、高热惊厥后遗、外伤、感染、中毒、颅内肿瘤、脑血管疾病、营养代谢性疾病等。