针对临床症状：首先对临床症状进行控制，进行维持性治疗。若出现精神症状，如记忆力减退或精神行为异常等，应给予抗精神类药物加以控制；若患者出现进食障碍、昏迷，应加强营养支持，如放置胃管等。
脑膜炎的治疗主要是根据脑脊液涂片和培养找到细菌，根据药物敏感试验选择有效的抗生素，及时治疗，争取减少后遗症的发生。还要对症处理高热，控制抽搐，减低颅内压，减轻脑水肿，还要使用激素减少颅内炎症粘连。抗生素对病毒性脑膜炎不起作用，应加用抗病毒的药物。
心理疗法。通过交谈了解患者的心理，对其进行开导，保持好的心态;鼓励患者参加各种活动，多于常人解除，解除心理阴影，对治疗有着很大的作用。饮食疗法：合理的饮食和充足的营养，是保证人体生长发育的必要条件，要合理安排饮食，营养均衡，纠正其不良习惯。
控制颅内高压、高热和抽搐发作尤为重要。昏迷病人需保持呼吸道通畅。精心护理可防止继发感染。患者在饮食中应该注意补充新鲜蔬菜水果及玉米、全小麦、豆类、蒜头、蘑菇、奶、沙丁鱼、瘦肉等食物。
治不好可以选择一些康复训练。婴幼儿患儿一定要注意翻身、抬头、坐、站、独立行走的能力训练，还需要关注孩子的智力康复，让孩子多听一些柔和的音乐，多进行互动和交流。
脑炎后遗症预防：对于继发性脑炎后遗症应预防其明确的特殊病因，产前注意母体健康，减少感染、营养缺乏及各系统疾病，使胎儿少受不良影响。防止分娩意外，新生儿产伤是脑炎后遗症发病的重要原因之一，避免产伤对预防脑炎后遗症有重要意义。