初期隐源性癫痫可以抑制病毒复制和清除病毒治疗；减轻症状和炎症，改善病情；包括抗病毒药、免疫调节、细胞因子、抗纤维化、反义寡核苷酸、核酶等。治疗有效的定义为，当感染由复制期转为整合期时，通常的结局是缓解而非治好。
初期隐源性癫痫除了积极的配合治外，日常护理对癫痫的治和康复也有着举足轻重的作用。癫痫者不能喝酒，不能抽烟；不能熬夜；不要吃易上火的东西；要保持良好的心境，不生气；适量的体育运动，加强体质，减少感冒的发生。
初期隐源性癫痫是一种神经系统的慢性疾病，对人体健康造成的危害的程度与癫痫病的严重程度有关，包括发作频率、持续时间、病史长短、临床表现、心理素质等方面。癫痫是一种脑部神经元异常放电的神经性疾病，癫痫病的治疗是根据病人的病情和身体状况来制定的治疗方案，一般指可以治疗的，不要轻易听信偏方治疗，以免有治疗不当是病情加重，给治疗带来难度。
隐源性癫痫是一种慢性疾病，在疾病初期，药物可以改善症状。但长期服用后患者就会感到药物有效时间缩短，一旦停药病情就会复发，甚至变得难以控制，对患者的身体也会产生一定的副作用。目前治疗隐源性癫痫的方法比较多，只有针对异常放电的脑神经以及脑细胞进行修复再生，恢复其正常的组织功能使其不再有异常放电的情况，从而可以达到治疗隐源性癫痫的目的。
隐源性癫痫不好治疗，需要去除原发病，一般很难查出病因，所以要长期服用抗癫痫药物。按时服药，不要私自减量或停药，定期检查血药浓度，保持良好的生活习惯，多注意个人卫生，避免不良生活。
隐源性癫痫初期可以不用手术，但对于药物久治不愈的难治性癫痫可以采用开颅手术的方法进行治疗。对于有病灶的继发性癫痫、定位明确手术效果好。不同的情况有不同的治疗原则。