甲状腺功能减退症对排卵有影响，但是否影响排卵期，这方面尚无专门研究加以论证或澄清。
一般认为，甲减患者会出现闭经等症状。但可以很清楚，甲减者排卵可受影响，表现为甲状腺功能减退症对内分泌系统的影响。对于内分泌系统来说，如果甲状腺功能降低，就会使垂体中激素水平下降，这样就可能引起黄体生成素减少，从而产生了低卵泡数现象，最终造成卵巢萎缩。
另一种是甲减，晚期可有垂体功能抑制，可有卵巢萎缩，这也会对排卵造成影响，因此，甲减对排卵的影响就很清楚了，但在排卵期会不会受到影响，目前还未见有关研究加以澄清。
一般情况下，甲减指的是甲状腺功能减退，甲状腺功能减退可能会影响怀孕。具体分析如下：
甲状腺功能减退通常会导致患者体内的甲状腺激素减少，可能会引起月经不调，导致排卵异常，从而影响受孕的几率.同时，如果在怀孕后出现甲状腺功能减退的情况，可能会引起流产、胎儿停育等。
如果在备孕期间出现甲减的情况，患者可以在医生的指导下服用左甲状腺素钠片、甲状腺片等药物进行治疗；同时合理调整饮食，减少高热量、高碘食物的摄入，有利于怀孕。
甲减亦即甲状腺功能减退，是由于甲状腺激素合成及分泌减少，或其生理效应不足所致机体代谢降低的一种疾病，通常出现甲状腺功能减退是会影响怀孕的，患甲减者不容易妊娠，因此，甲状腺功能减退患者应定期复查甲状腺功能并抽血检查，查甲状腺内激素水平，按激素水平用药，改善甲状腺功能。
此外，甲减患者应该注意合理饮食，怀孕期间应该合理用药。
妊娠期间甲减对孕妇的作用与甲减的严重程度有关，遗传的甲减会对胎儿的发育造成一定的不良反应，从而造成胎儿的生长发育滞后，甚至有可能造成流产的危险。
亚临床甲减是不是引起怀孕的原因，目前还没有定论，但在怀孕初期出现甲减，特别是临床性甲减，会对胎儿的长期智能产生一定的负面作用。总之，妊娠期间甲减对胎儿的影响，与怀孕期间的甲减有很大关系。
妊娠期临床甲减可增加妊娠不良结局发生的机会，并可对胎儿神经智力发育产生不利影响。
妊娠不良结局有早产，低体重儿，流产。妊娠期临床甲减流产风险将上升60%以上，妊娠期高血压风险上升30%以上，临床甲减孕妇死胎风险将上升。未处理临床甲减孕妇胎儿死亡、流产、循环系统畸形和低体重儿发生率可明显增加。临床甲减患者在妊娠期得到有效治疗后，可极大地减少以上情况发生。
临床甲减的孕妇在打算怀孕时需经过正规的左旋甲状腺激素替代治疗才能使甲状腺激素的含量恢复到正常水平。