桥本氏甲状腺炎目前尚无特异性治疗手段，大多数病人无需处理，诊断后可定期追踪观察。
桥本氏甲状腺炎属于自身免疫性甲状腺炎的一种，因自身免疫功能紊乱所致甲状腺疾病，它是遗传因素与环境因素相互作用的结果，临床上以大面积免疫紊乱为主要特征。存在临床型及亚临床型的甲减，以甲状腺功能下降为主采用甲状腺激素替代治疗，老年患者或慢性心功能不全者，应适当减量。目前尚无特效药物或根治药物，一般采取对症处理。桥本氏甲状腺炎的外科治疗较少，如压迫症状较重，或用甲状腺激素代用后，甲状腺仍有明显增大的患者，可考虑手术治疗。
桥本氏甲状腺炎症通常可以通过使用药物进行治疗。
桥本氏甲状腺炎属于自身免疫疾病，桥本氏甲状腺炎通常会导致甲状腺肿大，同时还会伴随甲状腺功能亢进的情况，后期还会出现甲状腺功能减退等情况。患有桥本甲状腺炎的病人，如果出现了甲状腺功能低下，可以选择使用甲状腺素制剂。对于有甲状腺功能亢进现象的病人，可以使用抗甲状腺的药物。
可以药物治疗，小剂量的药物对身体的副作用很小，只要找到合适的剂量定期复查甲状腺功能即可。也可以动态观察，半年到一年进行复查，根据甲状腺功能检查结果进一步制定治疗方案。
治疗方法如下：
一、药物治疗：1、左甲状腺激素片：患者甲状腺肿大明显，伴压迫症状，且伴甲状腺功能减退，给予左甲状腺激素片治疗，缩小甲状腺，补充甲状腺激素不足；2、受体阻滞剂：如有甲状腺功能亢进症状，可给予受体阻滞剂，必要时可给予少量抗甲状腺药物，但需密切观察甲状腺功能变化，警惕甲状腺功能减退的发生。
二、手术治疗：患者出现结节性甲状腺肿大，疑似恶性病变，有明显压迫症状，或给予甲状腺激素无明显疗效，立即行甲状腺穿刺活检或考虑手术治疗，术后长期给予甲状腺激素。
桥本氏甲状腺炎可以通过细针穿刺细胞学检查。
桥本甲状腺炎者，实际上，诊断要靠细针穿刺进行细胞学检查，但因细针穿刺细胞学检查为有创见，病人经过检查，可和给病人经济方面带来负担，又会给病人带来生理上的伤害。因此，很多人都会选择不用这种方式来检查。因此现在还不是很普遍，对桥本甲状腺炎病人，确诊时，可依赖血中检出甲状腺相关抗体增加，甲状腺相关抗体异常等，通常为桥本甲状腺炎确诊之主要依据。
通常来说，桥本氏甲状腺炎一般不能够自愈，所以“桥本氏甲状腺炎自愈率是多少”的说法是错误的。
桥本氏甲状腺炎分3个阶段，早期称为甲亢期，中期称为甲亢甲减并存期，晚期称为甲减期。一经发现，必须尽快到医院进行治疗，否则会病情加重，甚至会出现甲亢危象或者甲状腺功能减退的现象。
患者在治疗期间注意清淡低盐饮食，尽量避免吸烟饮酒，减少高蛋白、高热量、刺激性、生冷食物的摄入。还可适当进行体育锻炼，有助于增强体质。