通常来说，植物神经的紊乱可以通过一般治疗、使用药物等方法进行治疗。
1.一般治疗：为了促进病情恢复，患者应该注意一般治疗，即注意休息，避免过度劳累，也可以适当食用营养丰富的食物，有助于缓解症状。
2.使用药物：如果症状较重，为了控制病情，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有左归丸、百合地黄汤、甘麦大枣汤等。
平时要培养合理健康的饮食习惯，平衡营养膳食，尽量多进行户外活动，多参加体育锻炼，培养良好的生活习惯，早睡早起，生活要有规律。自我调整好心态，放松精神，保持好良好的情绪，良好的情绪有利于神经系统和各器官系统的协调统一，使机体生理处于好的状态。
植物神经功能障碍常伴有与神经症、忧郁症、恐惧症等有关的神经症。主要是因为精神紧张、工作压力过大、情绪激动、睡眠质量差等引起的。在早期的治疗中要注意调节自己的心态，要注意保持心情稳定，减少工作压力，调节睡眠，要多在户外活动，多呼吸新鲜的空气，可以服用解郁安神冲剂、刺五加、谷维素等中药，必要时可以服用一些汤药，可以服用六君子汤，也可以服用补中益气汤，心火旺盛的人可以服用朱砂安神丸，如果是肝胆火旺，可以服用龙胆泻肝汤。
植物功能神经紊乱可以使用助眠的药物调理，植物神经紊乱对睡眠的质量会造成比较大的影响，这种症状一般都是对症治疗，使用药物要在医生或者是药师的指导下用药，不可以盲目的自行乱用，会产生比较大的副作用，用药的时候也要严格的控制剂量，平时要在生活方面加以调理，尽量早睡早起。
植物神经功能紊乱治疗，主要要去除诱发的因素，心理疏导、病因治疗及药物治疗。心理疏导是做心理治疗，缓解精神压力，从精神紧张中解脱出来，注意生活规律。要给调节植物神经功能的药物，最常用的就是谷维素、维生素B1、B6。也可以给对症治疗的药物。
有植物神经紊乱现象病患可以采取生物反馈疗法，生物反馈的具体治疗是将病人体内生理活动的信屈、记录下来，并经过仪器放大变成们可以看见或听见的信号，让病人根据这些信息信号，在一定范围内调节控制自己的生理活动。