一般不会有特别的治疗，但是当肌鞘囊肿逐渐变大时，可以用手指挤压，用拳击打。在摔碎或挤压的时候，会感觉到一些痛苦，不过不会持续很久，并不会对身体造成严重的伤害。
不推荐在没有挤压时重复使用挤压的方式进行治疗，必要时有采用手术进行切除，由于肌腱鞘囊肿的手术比较容易，所以术后的复发率很低，患者不必过多担忧。
足部腱鞘囊肿的疼痛进行止痛，一般可在医生指导下口服布洛芬缓释片、芬必地等镇痛药，如果出现比较剧烈的情况，可以口服洛索洛芬钠、吲哚美辛等非甾体抗炎药。不过脚部腱鞘囊肿要注意控制，避免过度的运动，以免引起囊肿的其它变化。如果是足部腱鞘囊肿，可以通过外科切除和抽出脓汁来进行修复，有助于尽快改善病情，进而达到止痛的目的。
一般情况下，用挤压的方法可以治疗腱鞘囊肿，但是这样做有可能引起疾病，所以采用外科治疗比较好。最好是到正规的医院做个全面的体检，然后按照自己的医生说的做相应的处理。腱鞘囊肿是由于结缔组织内部的局部的退化所致，一般是由于劳累、创伤、机械性刺激等因素所致。
在这个时期要注意不要食用辛辣和刺激性的食品，否则会加重病情。日常生活中要多休息，工作后可以用温水冲洗伤口，促进气血循环。
如果腱鞘囊肿很痛，可以通过热敷、使用药物、手术治疗等方式改善。
1、热敷：腱鞘囊肿通常会导致局部出现肿块，可能伴有疼痛症状。患者可以用热毛巾来热敷患处，以缓解疼痛。
2、使用药物：如果腱鞘囊肿所致的疼痛症状难以忍受，患者可以遵医嘱使用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片等药物来减轻疼痛感。
3、手术治疗：如果疼痛症状持续存在，或反复出现，建议腱鞘囊肿患者及时进行手术治疗，将病变组织切除，以促使身体状况好转。
通常来说，足部腱鞘囊肿痛建议进行一般治疗、药物治疗、手术治疗等。
足部腱鞘囊肿有痛感时，可以以休息为主，尽量不要剧烈运动，尽量不要做太多的运动。局部的疼痛不能得到改善，可以使用穿刺针穿刺，抽出滑液，然后在局部注入乙酸泼尼松龙注射液，然后进行压力和绷带，如果不能改善，可以进行局部手术，这样会有一定的复发几率。
一般情况下，做腱鞘囊肿的手术不痛，在做完腱鞘囊肿之前，要先进行利多卡因的局部浸润麻醉，这样可以在术后起到明显的作用，整个过程中不会有任何的痛苦，而且可以维持2-3个小时。
除了麻醉的时候会造成很大的痛苦。对于囊腔大，囊壁厚度大，并会影响到关节的屈、伸运动，是治疗肌腱鞘囊肿的外科治疗。手术完全去除了囊腔，去除了液体，并对周围的粘连和压迫的组织进行了清理，三个星期之内不能做任何的剧烈的活动和负担。