蹲时间长了膝盖疼，主要是因为膝关节的部分承重会增大，从而导致膝关节周围肌肉、肌腱组织的疲劳，肌肉疲劳会导致肌肉中的酸性物质沉积，不能及时排泄出来。此外，长期坐着伸展、弯曲的姿势，会导致局部的血液流通不顺畅，导致膝关节和周边组织的疼痛。患者应适当活动膝盖，也可以用热毛巾对局部进行热敷，有利于改善相关情况。
引发膝盖疼的主要原因是骨关节炎，它是由于关节炎软骨遭到破坏，导致的关节炎疼痛，而且这种疼痛随着季节的变化日益增加。膝关节疼痛有两种情况一风湿，再就是缺钙引起的。
膝盖痛是膝关节周围软组织的损伤，包括皮下组织、韧带、肌肉、关节里面的骨头、半月板、关节软骨。正常来说，膝盖附近的疼痛属于软组织的伤害。如果出现软组织损伤，可以先进行膝关节的休息，再进行膝关节的保暖，可以外用一些消炎止痛的药物，还可以服用一些消炎止痛的药物。膝关节的疼痛是比较严重的，要做膝关节的片子，检查膝关节内的骨骼是否有增生、退变、骨关节病等。
下蹲膝盖疼可能是以下原因导致的：
主要是由于锻炼过度造成膝关节周围的肌肉受损，引起的下蹲膝盖疼。长时间的劳累也会引起腿上的肌肉的劳累，也会引起其它的肌肉炎症，引起疼痛。如果是在中老年人群，那么就会出现膝盖关节炎的症状。长时间处在阴凉、潮湿的地方，可能与风湿、类风湿性关节炎有关。如果不小心受到外伤，容易发生骨折，可能会引起下蹲膝盖疼。
站久了膝盖疼多见半月板损伤，膝盖内部的半月板在姿势不当、扭伤的时候可以导致半月板撕裂以及损伤等，同时会伴有关节腔内部有积液。可以行膝关节核磁共振检查，一般能够明确诊断，诊断之后如果损伤的半月板比较严重，可能还需要做关节镜的检查和治疗。另外年龄大的病人有可能会出现膝关节磨损、骨关节炎等病变，在拍片检查的时候能看到膝关节处有畸形，并且软骨面消失，必要的时候可以做膝关节置换手术。