通常来说，手腕腱鞘囊肿治疗方法是封闭治疗、使用药物等。
1.封闭治疗：手腕腱鞘囊肿是一种肿胀，是指发生于关节囊或腱鞘附近的一种内含胶冻状粘液的良性肿块，可能需要通过封闭治疗来缓解。
2.使用药物：手腕腱鞘囊肿多为单房性，也可为多房性，发病部位会有酸痛，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，比如布洛芬缓释胶囊、萘普生片等。
在临床上经常会碰到腕部的肌腱鞘囊肿，一般情况下，可以用压迫的方式将其撕裂，让其自身吸收。
对于那些与关节腔相连的囊肿，可以用针刺，把囊内的液体取出，然后进行压力包扎，或者是在取出囊内注入激素，再用压力包扎两日。可以做手术，术后要经常换药，并定时去医院做检查。通常情况下，肿瘤摘除后很难再出现，但仍有可能再次出现，因此要经常复查。
手腕腱鞘囊肿最佳治疗方法通过手术将腱鞘囊肿彻底摘除腱鞘囊肿。腕部腱鞘囊肿是目前最好的治疗方式，由于囊肿是由深层次引起的，至今没有其它的办法可以根治。手术分为开放性手术、关节镜手术等。如果囊肿很大，并且多次采用保守疗法，则需要外科手术。或者是由于囊肿比较大，会对关节的外观和功能造成一定的影响，出现酸、胀、痛等不适感，需要及时进行手术治疗。若不及时治疗，病灶愈大，损害愈严重。
要看腱鞘囊肿的大小和对关节的影响程度。如果腱鞘囊肿比较小，对周围关节没有影响，或者对手部的功能也没有影响，暂时观察。如果腱鞘囊肿比较大，或者是近期生长比较明显，伴有周围的疼痛，影响腕关节活动，或者是影响手部肌腱功能，影响手部活动，可以选择手术治疗，手术完整切除囊肿，改善腕部功能和手部功能。
手腕部位腱鞘囊肿经挤压可破裂并能减轻。
腱鞘囊肿有许多是由关节产生的，可采用按摩、揉捏、试着能否使其进入关节腔的方法。还可设法将腱鞘囊肿顶入骨内，强行挤压可将囊肿击碎。但由于囊壁尚存在，此种治疗复发机会较多。建议到医院做手术彻底切除，效果会更好。
建议患者在日常不要自行挤破腱鞘囊肿，避免引发不适症状。
手腕腱鞘囊肿可以揉。
手腕腱鞘囊肿可以用手揉搓，通常情况下，采用手法处理，囊壁较薄，囊腔内压力大的囊肿，可以用手挤压，让囊腔里的液体排出来，以缓解症状，达到治疗手腕腱鞘囊肿饿目的。如果囊腔很厚，囊里的压力不大，可以用无菌针先刺穿，等液体完全排出来后再进行加压包扎。但如果出现了反复的腱鞘囊肿，则需要进行外科治疗。