具体如何治疗，要根据囊肿引起的症状来确定。如果没有什么征兆，就是身体检查的时候发现了一个肿块，没有疼痛，没有麻木，没有脚踝的活动，没有其他的约束，那么就可以不用了。不用治疗，只需定期复查即可。如果出现了症状，但没有明显的症状，仅有轻微的触痛和麻木，并且在运动时感觉到轻微的疼痛，可以通过缓解疼痛来进行对症治疗。如果有轻度的疼痛，可以外用一些止痛的药物，比如扶他林。如果出现剧烈的疼痛症状，可以服用一些止痛药，比如西乐葆、扶他林等。如果囊肿有明显的疼痛、局部麻木、踝关节活动受到限制，可以考虑做外科手术。麻醉下，切除囊肿。如果囊肿表面较浅，体积较小，可以采用局部麻醉。如果是深的，靠近骨面，面积很大，局部麻的话，可能会起到很大的作用，我们可能会用到腰麻，或者是更高级别的麻醉，在门诊是做不到的。
腱鞘囊肿可伴有长期劳损、感染等，伤害和其他原因之间存在某种联系。患者一般会出现一侧或者双侧疼痛的症状，也有一部分是单侧疼痛。以病部圆形肿块为主，有些酸疼。随着人们生活水平不断提高，越来越多的人患有不同程度的腱鞘炎症状。对腱鞘囊肿有非手术治疗与手术治疗两种。非手术治疗就是用药物或者是针灸来进行治疗。保守治疗是用挤压的方法将腱鞘囊肿击碎，接着，泡液就渐渐地自己吸收了，但也存在一定复发机会。手术疗法是对已经发生了病变的患者进行彻底的破坏。操作方法是可摘除腱鞘囊肿，手术后注意防护，避免反复发作。
手心腱鞘囊肿的处理方式，要看患者的腱鞘囊肿的时间、体积和坚硬程度来处理。
如果患者的腱鞘囊肿的时间短，体积小和坚硬程度比较轻，一般情况下，用两个大拇指挤压可以挤压，但如果是长期存在的，局部坚硬、囊肿大的情况，需要做外科切除，以免耽误病情，影响日常生活以及身体健康。平时应注意休息，适当放松局部，避免病情加重。
对腱鞘囊肿多数不会造成明显症状，无需特别处理，主动多加注意休息即可，切忌重复推拿按摩局部。
若腱鞘囊肿渐大，局部有疼痛表现，甚至有血管神经性压迫，需积极手术。由于肌腱囊性增生是一种自身免疫性疾病，因此不能单纯用药物来控制病情发展，应及时到医院就诊检查确诊后再选择适当的方法治疗。
日常生活中加强对身体各部位的护理工作，预防和缓解因外伤等原因造成的损伤。生活上要养成良好的生活习惯，早睡早起，保证充足的睡眠时间。
手背上有腱鞘囊肿，如症状不明显，无需特别处理，但仍应主动注意休息，忌手指手腕过动。因为肌腱和关节都是在人体内部存在着一定位置的结构，一旦这个部位受到损伤，就会导致整个组织发生一系列的变化，所以必须要及时地对其进行处理。若腱鞘囊肿渐大，并有一定痛苦表现，可主动手术切除，手术切除后，也应加强休息，否则很可能反复发作。