脂肪肝的检查主要是对肝功能的检查，肝功能有5项检查，主要是谷丙转氨酶，谷草转氨酶总胆红素，直接胆红素和间接胆红素，如果在检查过程中这5项的数值超过正常值，则代表了肝脏受到损伤，脂肪化到10%以上，则是脂肪肝。
如果出现了脂肪性肝炎，病人可以出现转氨酶升高，比如谷丙转氨酶、谷草转氨酶出现升高，甚至出现胆固醇的升高，检查血脂往往伴有高脂血症。在彩超上可以发现肝脏有大量的脂肪浸润，往往伴有肝脏增大，这是单纯性的脂肪肝。
肝脏指标最常见的是肝功能各项检查结果，比如转氨酶升高提示有肝细胞损害。直接胆红素、谷氨酰转肽酶和碱性磷酸酶明显升高，提示存在胆道梗阻。间接胆红素明显升高，提示肝细胞的转化能力降低或者红细胞破坏能力增强。球蛋白数值升高提示机体免疫亢进，有可能存在病毒性肝炎。肝纤四项和肝脏硬度数值升高，提示存在不同程度的肝脏纤维化，这是由于肝细胞炎症导致的。乙肝五项中乙肝表面抗原升高，提示机体感染乙肝病毒。
自免肝是自身免疫性肝病的简称，主要看以下指标：
自身免疫性肝病是自身抗体攻击肝细胞引起的疾病。分为三种，一种是自身免疫性肝炎，主要指标是转氨酶和IgG。第二种是原发性胆汁性肝硬化，其主要指标为碱性磷酸酶升高2倍以上，伴有AMA、M2型(+)。患者的胆管也可能有肉芽肿性改变。第三种是原发性硬化性胆管炎，这类疾病主要以影像学检查为主，可检出明显的胆管梗阻。
一般来说，总胆固醇是一种检查血脂的重要指标，它的作用就是及早发现动脉硬化的危险，并对其进行监测。不同年龄、家庭、性别、遗传、饮食、心理等因素对血清总胆固醇有一定的影响。总胆固醇低的原因是：1、甲状腺功能亢进症。2.肝硬化、重症肝炎等严重肝病。3.贫血、营养不良、恶性疾病等.4.使用特定的药物，例如：雌性激素、甲状腺激素、钙离子拮抗剂等。
