生理性卵巢囊肿可能会有腹部肿物、小腹疼痛、月经失常等症状及表现，有些患者可能还会出现压迫症状。
1、腹部肿物：患者按腹部可以发现腹内肿物、腹胀不适，或在妇科检查时发现附件肿块。
2、小腹疼痛：卵巢囊肿患者感觉腹痛，尤其忽然发生者，多系囊肿蒂发生扭转，偶或为囊肿破裂、出血或感染所致。
3、月经失常：一侧卵巢甚至双侧卵巢囊肿，由于并不破坏所有的正常卵巢组织，故多半不引起月经失常。而月经失常患者常伴有卵巢生理性囊肿，如卵泡囊肿等，部分患者会因卵巢囊肿影响卵巢的内分泌功能而出现绝经后出血的现象。
4、压迫症状：如膀胱受压，可引起尿频、尿急、排尿困难或尿潴留；如压迫消化道，可引起上腹不适、食欲减退、下坠感或排便困难。
卵巢囊肿就是指卵巢内有囊性的肿物形成，可分为肿瘤性和非肿瘤性两类，而通常人们说的生理性卵巢囊肿是指非肿瘤性的那一类。生理性卵巢囊肿是最常见的卵巢囊肿，一般发生在排卵期的育龄妇女，生理性卵巢囊肿一般会自动消失。
一般情况下，生理性卵巢囊肿可以采用以下方式来去除：
患有生理性卵巢囊肿，没有出现明显的不适症状，可以暂时不治疗，进行临床观察。生理性囊肿一般会自己消失。患有生理性卵巢囊肿，如果囊肿很大，有腹胀、腹部疼痛等症状，可以进行穿刺。生理性卵巢囊肿如果在短期内增加的幅度很大，可以进行手术来切除。患者可以根据自身的实际情况，选择适合自己的治疗方式。
良性囊肿如滤泡囊肿在5厘米以下约5厘米。此时，应观察三个月。如果卵泡囊肿在约两个月内缩小或不增加，那么囊肿就会持续一段时间。将自行消失，不需要手术。但是，如果囊肿继续增大，则必须通过外科手术治疗。
卵巢囊肿在早期并无明显的临床表现，病人往往因其他疾病就医在行妇科检查时才被发现，以后随着肿瘤的生长，病人有所感觉，其症状与体征因肿瘤的性质，大小，发展，有无继发变性或并发症而不同。生理性囊肿要定期复查彩超，只要没有再出现就可以。生活要保暖防寒，不要接触冷水冷风。
较多见的生理性卵巢囊肿是月经周期中正常的卵泡持续生长，这种囊肿通常不会引发健康问题，也很少导致身体疼痛不适，一般在2~3个月经周期会自行消失，不需要进行治疗。如果反复出现生理性卵巢囊肿，女性患者就要及时去医院做性激素六项检查，同时也要改善自己的生活方式，改善饮食习惯，避免吃辛辣刺激性食物，避免吃富含激素的食物。