肛瘘是常见的肛门直肠周围良性病变，通常继发于肛周脓肿切口引流或者脓肿自行破溃之后。肛瘘的出血与此有关系，因为，肛瘘形成后，瘘管里面的组织仍然处于感染状态，可能因为不好的肉芽组织生长，继发坏死脱落而出现出血现象，这种出血往往是脓血样的出血，可以混有坏死组织。
肛瘘是常见的肛肠疾病，是指肛管直肠与肛门四周皮肤相通的感染性管道，外口位于四周皮肤上，瘘口长年不愈。当外口愈合，瘿管中有脓肿形成时，可感到明显疼痛，同时可伴有发热。
肛瘘是由于肠道内细菌感染，“肠道菌”是源头，是致病的要素。“肛窦”是感染的入口，也是脓肿和成瘘后的内口。“肛腺”是感染的途径，它先发生感染，然后蔓延。“肛周间隙”是最终的发病部位。肠道菌进入肛窦致其发炎，堵塞肛腺开口，致肛腺液流出受阻，引起肛腺感染，感染通过肌间隙、淋巴管蔓延至肛周间隙，最后形成肛管直肠周围脓肿。
肛门直肠周围脓肿破溃或切开多在肛门外，脓液从外口流出，但原发感染多在肛窦。肛窦则是继发感染的门户，反复感染，形成瘘道。直肠内有一定的压力，将直肠感染物质如粪便、气体，可经常不断地从内口进入瘘道，刺激腔壁，继发感染后由外口排出，也是造成瘘道的原因。
肛瘘手术后长肉芽是正常现象，一般肛瘘术后1个星期内，肉芽可以慢慢让无效腔变平，不会有窦道或无效腔，不会出现复发。只要创面低于切口的平面，皮肤能爬过去，伤口就可以进一步生长。
