种植学说，化生学说和上皮由来学说。常见的有经血逆流，医源性种植，淋巴传播和血管播散等，因为还有免疫学说。只要表现是痛经，而且还会进行性加重，另外还有性交痛，不孕或者月经失调等症状。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，即有生长能力的子宫内膜组织出现在子宫腔以外部位，就是子宫内膜出现在一个不该出现的部位。长在卵巢上的异位症经常形成囊肿，因囊肿内的出血日积月累，变得象巧克力浆一样，所以称“巧克力囊肿”。
巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种表现，简单来说就是子宫内膜异位到卵巢上，每个月随着卵巢激素的周期性变化，局部出现出血，形成血肿，血肿内的血液经过吸收后，变得较为粘稠，成巧克力汁状。
巧克力囊肿是子宫内膜异位引起，严重时可以导致组织器官黏连引起不孕。现在手术后打针考虑是为了减少复发。打针期间有正常的性生活，没有避孕的情况下，是可以有怀孕的几率。打针防止复发的药物没有避孕的作用。只要是有精子和卵子结合，就可以怀孕。具体要去医院检查看看的。
发生巧克力囊肿主要的病因是内分泌的因素，其次，分娩多次流产可引起输卵管堵塞，也是巧克力囊肿的病因之一，性生活过于频繁，也是导致巧克力囊肿的重要原因。也可能和压力过大等因素有关。
不一定，要根据身体的情况来定，另外注意是否影响了内分泌。如果月经持续不来，可以到妇科就诊做一下性激素等检查，根据检查选择治疗。注意不要吃生冷辛辣刺激的食物，要注意卫生，注意休息。
