三个月宝宝咳嗽、鼻塞可能是呼吸道感染导致的，具体分析如下：
三个月宝宝咳嗽、鼻塞，可以判断存在呼吸道感染。常见的有打喷嚏、发烧、咳嗽、流鼻涕等症状。建议带着孩子到医院检查一下血常规和炎症指标，看是不是病毒感染引起的，还是细菌感染引起的。如果是病毒感染，可以服用一些抗病毒的药物。如果是细菌感染，可以服用抗炎的药物。要注意肺部感染，要做胸部X光检查。
三个月宝宝咳嗽可能是生理原因引起的，也可能是存在疾病。
三个月宝宝咳嗽，要看小孩咳嗽的程度。如果只是咳一声、半声或者偶尔咳嗽，可以遵医嘱用甘草口服液，然后进行观察。宝宝在喝完奶后会出现咳嗽，要注意是否有一点噎着，因为奶量多了，宝宝还没有下咽。在给宝宝喂奶之前，可以用手指捏着宝宝妈妈的奶嘴，避免给宝宝喂奶。还要注意宝宝是否有打喷嚏、流鼻涕、发烧等症状，如果是感冒了，可以遵医嘱服用抗病毒、止咳的药物。母乳喂养的孩子要注意饮食，海鲜、鱼虾、肉、膨化剂、添加剂、小零食油炸、油腻、辛辣刺激的食物都要尽量少吃。如果宝宝咳嗽加重，可作雾化。出现呼吸困难、喘息等症状时，要及时就医。
三个月宝宝偶尔咳嗽几声，可能是感冒、急性支气管炎、呛奶等原因导致的。
1.感冒：三个月宝宝如果穿衣服过少，可能会导致受凉容易诱发感冒，从而引起偶尔咳嗽几声，还会伴有鼻塞、流鼻涕、打喷嚏等症状。
2.急性支气管炎：如果三个月宝宝患有急性支气管炎，病情比较轻微，症状也可能会比较轻微，出现偶尔咳嗽几声的情况。
3.呛奶：如果三个月宝宝吃奶过急，可能会发生呛奶，从而引起偶尔咳嗽几声。
三个月的孩子出现咳嗽症状，可能是以下原因导致:
1、呼吸道的因素，比如呼吸道感染，有上呼吸道感染，下呼吸道感染肺炎，经常会咳嗽，喉炎也会咳嗽，气道高反应性也会咳嗽。
2、局部因素，比如解剖发育上特点，小婴儿的胃是横位，喷门口比较松，幽门的口比较紧，容易胃食道反流，胃食道反流就导致咳嗽，呛奶以后也会咳嗽。
三个月宝宝咳嗽吐奶考虑是感染引起的。
三个月的宝宝咳嗽、吐奶，通常是由于细菌感染、病毒感染、肺炎支原体、衣原体等病原体感染导致的。宝宝呼吸道感染时之所以会出现呕吐，是因为宝宝的胃、食道的生理结构。宝宝的胃是横向的，贲门括约肌比较松弛，而幽门括约肌比较发达，所以很容易让乳汁在胃里停留很久，咳嗽引起食道、胃的振动，乳汁就会从胃部回流到食道，从而引起呕吐。
如果婴儿早上咳嗽几次，没有问题。如果咳嗽很严重，可能是上呼吸道感染的问题。可以先给宝宝一个相对安全的饮食疗法，比如吃大蒜和冰糖开水，喝一点，保暖，避免感冒。如果婴儿的症状继续没有改善，让医生来看看，选择一种相对安全的药物进行对症治疗。